El protestantismo en Europa en el siglo XIX mostró algunas tendencias nuevas bajo el impacto del racionalismo durante la Ilustración. Influenciado por la filosofía crítica de Kant y el romanticismo de Schelling, Schleiermacher veía la religión como un producto de la emoción y enfatizó la importancia de la experiencia religiosa personal. Se le conoce como el padre de la teología protestante moderna. Más tarde, bajo la influencia de la filosofía de la historia de Hegel, un grupo de teólogos como Bauer y Strauss, con sede en la Universidad de Tubinga, proporcionaron nuevas interpretaciones de las creencias tradicionales y la historia del desarrollo del cristianismo primitivo. La Escuela de Tubinga jugó un papel muy importante en la promoción del desarrollo de la crítica bíblica. Richard propuso el lema "Volver a Kant" y consideró los valores morales como un arma mágica para defender el cristianismo. Bajo su influencia surgieron maestros teológicos liberales como Harnack y Truk. La teología liberal enfatiza el valor humano y la libertad. Sobre la premisa de preservar los valores morales, aboga por la reconciliación de la religión y la ciencia, la fe y la racionalidad, aboga por la reforma social y reemplaza la revolución por la reforma. Todavía hay algunas personas que, en la ola de la revolución social, intentan combinar las creencias cristianas y las ideas éticas con la reforma social. Por ejemplo, Morris y Kingsley en el Reino Unido propusieron el "socialismo cristiano" y Bush en los Estados Unidos propuso la idea del "evangelio social".
Las diversas crisis del mundo occidental en el siglo XX, especialmente las dos guerras mundiales, pusieron a la teología liberal en una situación desesperada. Fue reemplazada por la teología neoortodoxa representada por Barthes y Brunel. Enfatiza la depravación y el pecado de la humanidad y declara que la humanidad nunca podrá revertir la historia. Sólo negándose a uno mismo, obedeciendo completamente la voluntad de Dios y utilizando "las palabras de Dios" como base para el juicio, la humanidad podrá salvarse. Pretendía ser un retorno a la ortodoxia de Lutero y Calvino, al verdadero significado del evangelio de Agustín y Pablo. Después de la Segunda Guerra Mundial, el predominio de la teología liberal fue reemplazado por la teología neoortodoxa. Por otro lado, a principios del siglo XX surgió en el protestantismo estadounidense una tendencia antirracionalista, conocida como fundamentalismo, que competía con el modernismo, que reconciliaba fe y razón. El fundamentalismo cree que las enseñanzas tradicionales como el nacimiento virginal de Jesús, la resurrección física, la redención en la cruz, la segunda venida de Cristo y la infalibilidad de cada palabra de la Biblia deben aceptarse como arterias básicas de la fe. El ascenso del fundamentalismo ha sumido al protestantismo estadounidense en largos y amargos debates y ha provocado cismas en algunas denominaciones. Además, algunas sectas fundamentalistas se combinaron con espiritistas o espíritus que fomentaban el fanatismo religioso, lo que dio lugar a un "renacimiento religioso" en Europa y Estados Unidos, que impulsó el desarrollo de movimientos misioneros. Después de la Segunda Guerra Mundial, las enseñanzas tradicionales y la ética social del protestantismo se vieron impactadas por el secularismo, el escepticismo y diversas tendencias y problemas sociales. Las sectas principales están decayendo, sus seguidores están disminuyendo gradualmente y han surgido muchas sectas nuevas. A principios del siglo XX, algunas iglesias protestantes lanzaron el movimiento ecuménico en un intento de coordinar las relaciones y fortalecer la cooperación en el mundo cristiano. La Iglesia Ortodoxa también expresó su apoyo. Este movimiento, representado por el Consejo Mundial de Iglesias, no ha logrado formar un núcleo fuerte durante medio siglo. Los católicos y algunas iglesias protestantes no tradicionales con un gran número de seguidores aún no han participado. En el siglo XXI, el protestantismo se está desarrollando hacia la diversificación y la secularización, y muestra una tendencia a la rediferenciación y combinación.