La Universidad de Wuhan se remonta a la Escuela Ziqiang fundada en Wuchang en 1893 por Zhang Zhidong, el gobernador de Huguang. Después de herencia y evolución, fue nombrada Universidad Nacional de Wuhan en 1928. Fue una de las primeras universidades nacionales en la China moderna. Posteriormente se le cambió el nombre en 1949.
En 2000, la Universidad de Wuhan se fusionó con la Universidad de Energía Hidráulica y Eléctrica de Wuhan, la Universidad de Tecnología de Topografía y Cartografía de Wuhan y la Universidad Médica de Hubei para formar una nueva Universidad de Wuhan.
Hay 29.405 estudiantes de pregrado, 19.699 estudiantes de posgrado, 7.163 estudiantes de doctorado y 2.453 estudiantes extranjeros. La Universidad de Wuhan ocupa el puesto 257 en la Universidad Mundial 2020QS.