Hoy toca la última parte de la trilogía de replicación, transcripción y traducción viral: la traducción de proteínas virales. Siempre he pensado que los virus de ARN son más interesantes que los virus de ADN porque los virus de ARN son inestables y existen en muchos tipos. Hay muchos modos de replicación, transcripción y traducción. Lo mismo ocurre cuando se trata de traducción. Los virus de ADN no son más que ADN→ARNm→proteína, que es el método de traducción tradicional.
Sin embargo, los virus ARN son diferentes. Algunos virus comienzan como ARNm, y hay muchos ejemplos de ello, como el parvovirus, Flaviviridae, etc. Aunque este ARNm es monocis-trans, un cis-trans contiene múltiples secuencias de proteínas estructurales y no estructurales. Este ARNm se traduce en una poliproteína larga, que luego se hidroliza capa por capa para formar proteínas estructurales y no estructurales. Curiosamente, algunos de estos virus, que comienzan como ARNm, no contienen una estructura de tapa 5'. Si tiene una base sólida en bioquímica, debe saber que la subunidad del ribosoma encuentra la estructura de la tapa y luego se une a ella para iniciar la traducción. Pero al igual que el virus de la fiebre aftosa, no tiene estructura de límite. ¿Qué hacemos? Hay una estructura llamada sitio de entrada al ribosoma interno (IRES), que simplemente reemplaza la estructura de la tapa, se une al ribosoma e inicia la traducción. Existen cinco tipos de IRES, dependiendo principalmente de la estructura secundaria del ARN.
Existe otro fenómeno interesante en el proceso de traducción de ribosomas, que es el salto de ribosomas, que es muy interesante. Para decirlo sin rodeos, el ribosoma se desliza a lo largo del ARNm y, cuando encuentra una secuencia especial, se detiene con un "chasquido" (no se detiene). La cadena polipeptídica previamente traducida se desprende del ribosoma, que continúa deslizándose a lo largo del ARNm para traducir la proteína. ¿No es interesante? Muchos miembros de la familia de los picornavirus comparten esta propiedad.
Otro fenómeno interesante es el efecto de desplazamiento del ribosoma, que se divide en desplazamiento negativo o desplazamiento positivo (no lo recuerdo con claridad), es decir, el ribosoma se desliza normalmente a lo largo del ARNm, encuentra una secuencia especial y luego retrocede o "golpea" una posición de nucleótido hacia adelante y luego continúa la traducción, lo que hace que la secuencia de aminoácidos quede completamente desordenada en traducciones posteriores. Dos ejemplos típicos son los coronavirus (cambio negativo) y los virus de la influenza (cambio positivo). Efecto de reemplazo de ribosomas, mi memoria está un poco confusa, corríjame.
Acabo de hablar de dos ejemplos interesantes de ribosomas traviesos. Cuando el ribosoma se desliza a lo largo del ARNm, finaliza la traducción cuando encuentra un codón de parada (UAA, UGA, UAG). La proteína recién traducida se desprende del ribosoma y se somete a procesamiento adicional, como acetilación, glicosilación, formación de enlaces disulfuro, formación de estructuras de orden superior, polimerización, etc., para convertirse en una proteína madura.
Por cierto, una cosa más. En el último período he estado pensando erróneamente que los priones son el proceso de replicación de proteínas, pero estoy completamente equivocado. La esencia de un prión es que la proteína sufre un cambio conformacional, generalmente de una hélice α a una gran cantidad de láminas β, formando así un prión con propiedades neurotrópicas. Bueno, lo siento un poco por mis dos supervisores de doctorado. Ambos hombres eran expertos en la investigación de priones.
Detengámonos aquí. La trilogía ha terminado. Es hora de escribir sobre cómo un virus invade una célula y qué cosas malas hace dentro de ella. ? 2020-03-17
F. Liu (apellido)