En junio de 1998, la Facultad de Medicina de Xinjiang y la Facultad de Medicina Tradicional China de Xinjiang se fusionaron para formar la Universidad de Medicina de Xinjiang, por lo que la Facultad de Medicina de Xinjiang es la predecesora de la Universidad de Medicina de Xinjiang.
El primer hospital afiliado de la Universidad Médica de Xinjiang se fundó en 1956. Es uno de los 156 proyectos de construcción clave de la ayuda de la Unión Soviética al Primer Plan Quinquenal de China. Integrando tratamiento médico, enseñanza e investigación científica, es uno de los hospitales afiliados a la Universidad Médica de Xinjiang.
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