Existen varias situaciones.
Una es cuando no puedes pensar en qué decir de inmediato. El significado es el mismo que ぇぇと, similar a "ese~ ~~"
La otra es. para expresar no, equivalente a ぃや, ぃぃぇ(NO), etc.
ぅん significa sí. Además, también hay sonidos al ejercer fuerza, como por ejemplo, oye, oye.