En las células eucariotas, el ADN se encuentra en el núcleo, las mitocondrias y los cloroplastos. El núcleo es el centro de la información genética y contiene la mayor parte del ADN. La información genética se transmite mediante transcripción y traducción. Los cloroplastos y las mitocondrias tienen algunas funciones de transcripción y traducción autónomas, es decir, semiautónomas, y contienen una pequeña cantidad de ADN.
En las células procarióticas, el ADN se encuentra en el pseudonúcleo.