Desde finales de los años 1920 hasta los años 1930, Frankfurt ganó varios campeonatos locales y regionales, pero fue eliminado temprano en el campeonato nacional. En 1933, la Alemania nazi reformó el sistema de ligas alemán y lo dividió en 16 ligas regionales (Gauliga). El Eintracht Frankfurt fue asignado a la primera división "Gauliga Südwest" y a menudo mantuvo una posición superior, ganando el campeonato en 1938.
Después de la Segunda Guerra Mundial, el Frankfurt reanudó la competición en la Bundesliga Sur y ganó el campeonato divisional en 1953 y 1959 respectivamente. Después de ganar el campeonato por segunda vez, el Frankfurt derrotó al Offenbach Kickers por 5-3 y ganó el campeonato nacional alemán. De esta manera, Frankfurt se clasificó para la Copa de Europa y avanzó con éxito a las semifinales para enfrentarse al poderoso club de fútbol escocés Glasgow Rangers. Los equipos local y visitante derrotaron a sus oponentes 6-1 y 6-3 para llegar a la final y ganaron los cinco partidos en Hampden Park, Escocia, en mayo de 1960. Los resultados del Eintracht Frankfurt fueron aceptados y se convirtió en uno de los 16 equipos fundados en la recién creada Bundesliga profesional alemana en 1963. Mantuvieron la cima y la parte superior de la liga durante los siguientes 20 años, terminando terceros en la liga cinco veces, y en 1992 estaban sólo 2 puntos por detrás del eventual campeón Stuttgart.
Sin embargo, el Frankfurt sólo evitó el descenso en algunas ocasiones. En las dos rondas de los playoffs derrotó al Duisburg por 6-1 en 1984 y al Saarbrücken FC por 4-1 en 1989. Finalmente, en la temporada 1996/97 el Frankfurt descendió al grupo B junto con el Kaiserslautern. Estos dos equipos fueron los segundos de los cuatro equipos de la Bundesliga que conservaron su lugar en la Bundesliga en ese momento.
Dos años más tarde, el Frankfurt ganó el campeonato del Grupo B y volvió al Grupo A. Sin embargo, en la actual temporada (1998-99), debe luchar duro hasta la última ronda para evitar el descenso. Derrotaron al campeón defensor Kaiserslautern por 5-1 como invitado, y su principal rival, el Nuremberg Football Club, perdió inesperadamente en casa, lo que les permitió permanecer en el Grupo A. La temporada siguiente, se les descontaron 2 puntos debido a problemas económicos. Una vez más, en la ronda final de la competición, se escapó con un gol tardío en la victoria sobre el FC Ulm. El Eintracht volvió a sufrir dificultades financieras en 2004 y finalmente descendió. El Eintracht Frankfurt ganó la Copa de Alemania en 1974, 1975, 1981 y 1988. En 1980, derrotaron a otro equipo alemán, el Mönchengladbach, y ganaron la Copa de la UEFA.
El último buen resultado de Frankfurt en la copa fue su derrota ante el Bayern de Múnich en la final de la Copa de Alemania de 2006. Dado que el Bayern también es campeón de liga y está clasificado para la Copa de Europa, el Frankfurt puede participar en la Copa de la UEFA.