En comparación con los molinos mecánicos modernos, la ventaja de los molinos de agua es que no sobrecalientan los granos ni los muelen demasiado rápido, por lo que no se destruye el valor nutricional de los granos. Además, la fricción de la piedra producida por la molienda con agua puede triturar las partículas en la superficie del grano hasta convertirlas en un polvo más fino, que es fácil de digerir y absorber.
Aunque hay muchos equipos de alta tecnología que pueden reemplazar a los molinos de agua, en algunos lugares, los molinos de agua siguen siendo un símbolo de tradición y cultura. Algunas personas creen que el molino de agua no sólo proporciona harina de alta calidad, sino que también es un buen lugar para mostrar las costumbres y la artesanía tradicionales. Por ello, los molinos de agua son muy apreciados y protegidos en el mundo.