Pregunta: ¿Qué es la respiración de la doble hélice del ADN?

▓⊙ Las moléculas de ADN transportan información sobre la composición de aminoácidos de las proteínas e información sobre la selección y expresión de genes.

▓⊙ La mayor parte de la información relacionada con la biología y la expresión genética existe en las vibraciones de baja frecuencia causadas por fuerzas de largo alcance, lo que permite conversaciones a larga distancia entre varias partes de la secuencia del ADN.

▓⊙ La hidrólisis alcalina del ARN produce primero un producto intermedio de nucleótido cíclico 2' y 3'. Debido a la mala estabilidad del anillo de cinco miembros, rápidamente se convierte en nucleótido 2' y nucleótido 3'. mezcla.

▓⊙ El plano de la base y la hélice son básicamente perpendiculares. Los grupos amino y cetona en el anillo de purina y el anillo de pirimidina son hidrófilos, por lo que se pueden formar enlaces de hidrógeno entre las bases emparejadas. anillo El bucle en sí es hidrofóbico, por lo que las bases adyacentes en la misma cadena pueden formar una fuerza de apilamiento.

▓⊙ La distancia que cualquier cadena de la doble hélice se mueve hacia arriba y hacia abajo alrededor del eje se llama paso.

▓⊙ Fórmula relacional de Marmur-Dofy: G+C% está dentro del 30%-70%, en una solución de NaCl 0,15 M + citrato de sodio 0,015 M, el valor de Tm es: Tm = 69,3 + 0,41 (G +C)%

▓⊙ La urea y la formamida reducen el valor de Tm debido a que reducen la posibilidad de formación de enlaces de hidrógeno.

▓⊙ Los enlaces de hidrógeno son altamente direccionales. Cuando el átomo donante, el átomo de hidrógeno y el átomo aceptor están en la misma línea recta, el enlace de hidrógeno es más fuerte.

▓⊙ Los polioligonucleótidos tienden a tener una estructura tridimensional para maximizar el contacto de los grupos fosfato altamente solubles con el agua y minimizar el contacto de las bases con el agua.

▓⊙ Bobina aleatoria: En la larga cadena de un polímero, no existe interacción intracadena. Cada monómero puede girar libremente respecto a los monómeros adyacentes, y su límite es que solo dos átomos no pueden ocupar el mismo. espacio.

▓⊙ Las bases del ADN bicatenario están apiladas en mayor grado que las del ADN monocatenario. Esto se debe a los enlaces de hidrógeno entre las bases emparejadas de las dos cadenas. Los enlaces de hidrógeno máximos se logran cuando todas las bases apuntan en la dirección correcta. Las bases que han sido apiladas son más fáciles de unir y las bases que han sido orientadas mediante enlaces de hidrógeno son más fáciles de apilar.

▓⊙ El efecto de apilamiento de bases en la dirección de purina a pirimidina es mayor que el efecto de apilamiento de bases en la dirección de pirimidina a purina.

▓⊙ Respiración: En condiciones fisiológicas, los enlaces de hidrógeno entre los pares de bases de la doble hélice se rompen y regeneran constantemente.

▓⊙ En ambos extremos del ADN bicatenario, hay de 3 a 7 pares de bases en estado monocatenario en diversos grados. Este fenómeno se llama floración. (deshilachado)

▓⊙ La mayoría de los procariotas son anillos cerrados valentes, moléculas CCC. Luego gira en espiral hasta convertirse en una molécula superenrollada. Las superenrollamientos son direccionales y hay dos tipos: superenrollamientos positivos y superenrollamientos negativos.

▓⊙ Densidad superhélice (diferencia en la relación del número de enlaces): δ=τ/α°= (α-α°)/α°. El número de superenrollamientos por hélice primaria. La mayoría de las criaturas tienen un valor de -0..05. Relacionado con muchos procesos de la vida. Se convierte parcialmente en estructuras vesiculares monocatenarias en solución y dentro de las células. En cualquier momento, la proporción de partes monocatenarias de ADN superenrollado negativamente es mayor que la proporción de partes monocatenarias de ADN superenrollado positivamente.

▓⊙ En las células eucariotas, el superenrollamiento negativo del ADN es causado por la estructura de la cromatina, porque la dirección en la que el ADN se enrolla fuera del octámero de histonas favorece la transición del ADN a una dirección de enrollado suelto. . En las células procarióticas, TOPⅠ y TOPⅡ se introducen durante el proceso de consumo de ATP. Los reactivos que se intercalan entre bases adyacentes también cambian la topología del ADN.

▓⊙ El ADN es un polímero compuesto por ácidos desoxirribonucleicos unidos por enlaces fosfodiéster 3’5’. La mayor diferencia con el ARN es la presencia o ausencia de un átomo de oxígeno en la posición 2 de la ribosa.

▓⊙ A un pH de 11,5, casi no hay cambios en la estructura primaria del ADN, mientras que la cadena de ARN se degrada en 2'-mononucleótido y 3'-mononucleósido en unos pocos minutos. La hidrólisis alcalina del ARN forma primero un producto intermedio de mononucleótido cíclico 2'3', que luego se convierte en una mezcla de mononucleótido 2' y mononucleótido 3'.

▓⊙ En la secuenciación enzimática, la secuencia leída de la película X radionográfica del gel es la secuencia de la hebra complementaria. Este método se denomina método de copia indirecta.

▓⊙ Entre los factores que determinan el estado de la estructura de doble hélice del ADN, la fuerza de unión de bases complementarias y la fuerza de apilamiento de bases favorecen que DAN mantenga la estructura de doble hélice. La repulsión electrostática del grupo fosfato y la energía intramolecular de la base no favorecen que DAN mantenga la estructura de doble hélice.

▓⊙ Cuando la concentración es de 50μg/ml, la A260 del ADN de doble hélice es 1,00; la A260 del ADN monocatenario completamente desnaturalizado es 1,37 y la A260 de una mezcla en proporciones iguales de monocatenario; nucleósidos es 1,60. El aumento en la absorción de luz causado por la desnaturalización del ADN se llama efecto hipercrómico.

▓⊙ Para mantener el estado monocatenario del ADN, el pH debe ser >11,3 o la concentración de sal debe ser inferior a 0,01 mol/l.

▓⊙ La renaturalización del ADN es una reacción secundaria bimolecular. La tasa de desaparición de cadenas simples es ?dC/dt=KC2. K es la constante de la reacción secundaria. La unidad es litro/mosegundo. Depende de la concentración de cationes, la temperatura, el tamaño del fragmento y la complejidad de la secuencia de la molécula de ADN.

Las condiciones para la conformación ▓⊙ B son: concentración fisiológica de sal y 92% de humedad relativa. Las condiciones para la conformación A son: Na+, K+/Cs+ como contraiones y 75% de humedad relativa. Las condiciones para la conformación de C son: Li+ como contraión, 66% de humedad relativa. Tanto las dobles cadenas de ADN-ARN como las de ARN-ARN adoptan la conformación A.

▓⊙ La profundidad del surco depende de la posición del eje de la hélice, y el ancho del surco depende principalmente de la conformación cis-trans del enlace glicosídico en la posición relativa de los dos enlaces glicosídicos. y el par de bases.

▓⊙ En configuraciones de doble hélice derecha como B y A, los enlaces glicosídicos están en conformación trans. El enlace glicosídico de pirimidina en el ADN-Z todavía está en conformación trans, mientras que el enlace glicosídico de purina está en conformación cis.

▓⊙ Hipótesis invertida: en la transición de B a Z, la guanina envuelve el enlace glicosídico y cambia de trans a cis, mientras que la citosina y la ribosa se giran juntas.

▓⊙ El ADN-A, el ADN-B y el ADN-Z no solo representan una conformación única, sino que también representan un grupo de conformaciones relacionadas. Este grupo de conformaciones relacionadas se denomina familia conformacional.

▓⊙ El giro de la hélice significa que las dos bases de un par de bases no están en el mismo plano, sino que los ejes largos de las dos bases están torcidos en direcciones opuestas. Si miras a lo largo del eje longitudinal de las bases, la base más cercana siempre gira en el sentido de las agujas del reloj. El giro de la hélice siempre se define como un valor positivo. El ADN A es de 15° y el ADN B es de 12°.

▓⊙ Tome dos planos de base a través del eje largo del par de bases como plano del par de bases. El ángulo entre dos planos de pares de bases adyacentes se llama ángulo de rotación de la base. Si la abertura está en la dirección de la ranura menor, el ángulo de rotación de la base se define como un valor positivo.

▓⊙ El mecanismo de renaturalización del ADN incluye la nucleación y el cierre.

▓⊙ En la estructura del ADN, las características del surco juegan un papel clave en la expresión de la información genética. Las proteínas reguladoras reconocen la información genética del ADN formando enlaces de hidrógeno entre cadenas laterales de aminoácidos específicos en sus moléculas y posibles donantes o aceptores de átomos de hidrógeno en ambos lados de los pares de bases en el surco.

▓⊙ El método de reconocimiento de información de la proteína reguladora A-DNA es diferente al de B-DNA. La diferencia entre los dos es mayor que el método de reconocimiento de B-DNA y Z-DNA. -ADN, B-DNA pertenecen a la hélice derecha, mientras que Z-DNA pertenece a la hélice izquierda.

▓⊙ En cualquier momento, la proporción de la porción monocatenaria de ADN superenrollado negativo es mayor que la de cualquier otra forma de ADN bicatenario.

▓⊙ La esencia de la reacción catalizada por la ADN topoisomerasa es cortar primero los enlaces fosfodiéster del ADN, cambiar el número de enlaces de ADN y luego conectarlos. Es tanto una ADN endonucleasa como una ADN ligasa. La función no puede conectar ADN roto preexistente, y su reacción de ruptura y reacción de ligación están acopladas.

▓⊙ Además de la ADN topoisomerasa, que puede producir cambios isoméricos, muchos reactivos que pueden insertarse entre bases adyacentes y afectar el apilamiento de bases, especialmente las moléculas de tinte en forma de escamas, también pueden cambiar el estado topológico.

▓⊙ Cuando el ADN circular se desnaturaliza en álcali o térmicamente, los enlaces de hidrógeno se rompen y las dos cadenas no se pueden separar, lo que da como resultado una molécula con dos cadenas fuertemente entrelazadas, es decir, ADN colapsado, que Tiene un coeficiente de sedimentación anormalmente alto, llegando a 3.

▓⊙ El número de cromosomas haploides de una especie es el genoma de la especie. El contenido de ADN de un genoma haploide es fijo, lo que generalmente se denomina valor C de la especie.

▓⊙ En la fase de crecimiento logarítmico de E. coli, cada célula puede tener de 2 a 4 moléculas de ADN idénticas formando un nucleoide.

▓⊙ Cualquier secuencia de ADN repetida en tándem, independientemente de si contiene información genética codificada, estará sujeta a homogeneización, y el mecanismo es la fijación de intercambio y la conversión de genes.

▓⊙ El posicionamiento de los nucleosomas no está determinado principalmente por la interacción entre los octámeros de histonas y secuencias específicas de ADN, sino por las características inherentes de la propia doble hélice del ADN.

▓⊙ El reconocimiento específico del ADN por los octámeros de histonas debe ser el resultado de la interacción con todo el ADN central. La secuencia de ADN ubicada en el punto de simetría bipartita del octámero debe ser más importante que otras secuencias en ambos lados.

▓⊙ La dirección del ADN en el nucleosoma está determinada por la conformación del tetrámero (H3)3 (H4)3. El ADN siempre está enrollado en la dirección izquierda del nucleosoma.

▓⊙ Los telómeros, los centrómeros y los orígenes de replicación del ADN son los tres elementos indispensables que constituyen los cromosomas.

1. El principio de emparejamiento de bases complementarias es la base de la estructura y función del ADN. El emparejamiento estricto de A-T (o A-U) y G-C no solo garantiza la estabilidad de las moléculas de ADN, sino que también permite que el ADN complete con precisión funciones como la replicación, la transcripción y la traducción. Por lo tanto, sólo comprendiendo el núcleo del emparejamiento de bases complementarias podremos comprender profundamente la estructura y función del ADN.

2. Excepto unos pocos organismos que utilizan ARN como material genético (como el virus del mosaico del tabaco), la mayoría de los organismos utilizan ADN como material genético. Entonces el ADN es el principal material genético. Y el ADN existe principalmente en el núcleo. El ADN en el núcleo utiliza cromosomas como portadores, por lo que también decimos que los cromosomas son los principales portadores de material genético. Pero para el ADN de los cloroplastos y las mitocondrias, así como para el material genético de las células procarióticas, virus y otros organismos, los cromosomas no se utilizan como portadores.

3. Al aprender la estructura del ADN, debes comprender la jerarquía estructural del ADN.

Esta estructura del ADN determina su estabilidad, diversidad y especificidad

4. La replicación del ADN es una de las funciones del ADN. El método de copia se puede resumir en dos puntos: ① Copiar sin rotar; ② Copia semiconservada. Este método de copia garantiza la precisión de la copia.

El proceso de replicación requiere condiciones básicas como plantillas, materias primas, energía y enzimas.

5. La diferencia entre ADN y ARN:

ADN

ARN

Nombre

Ácido desoxirribonucleico

Ácido ribonucleico

Distribución

Distribuido principalmente en el núcleo

Distribuido principalmente en el citoplasma

Estructura p>

Estructura regular de doble hélice

Estructura generalmente monocatenaria

Unidad básica

Desoxirribonucleótido

Ribonucleótido

Azúcar de cinco carbonos

Desoxirribosa

Ribosa

Base

A, G, C, T

A, G, C, U

6. Hay tres tipos de ARN: ARN mensajero (ARNm), ARN de transferencia (ARNt), ARN ribosómico (ARNr). se refiere a la secuencia de bases del ARNm, no a la secuencia de bases del ADN. Por supuesto, el código genético del ARNm se transcribe a partir de la información genética del ADN.

Las tres bases adyacentes del ARNm que determinan un aminoácido se denominan codones.

El hecho de que casi todos los organismos, desde virus hasta animales superiores y plantas, utilicen el mismo conjunto de codones es una fuerte evidencia de que los organismos están relacionados entre sí.

Durante el proceso de traducción, no hay superposición entre codones adyacentes en el ARNm y no hay comas.

Materiales de referencia: