En el tercer año del reinado del Khan, Kublai Khan nombró a Guo Shoujing, un experto Han en conservación del agua de 31 años, para "despejar el camino" antes de la fundación del país. Durante la dinastía Song del Sur, Boyan, un general de la dinastía Yuan, era profundamente consciente de la importancia de las vías fluviales para el ejército y la economía, por lo que "nadó el río Dadu desde Jiangdu". Después de la caída de la dinastía Song del Sur, con el apoyo de otros dignatarios, Kublai Khan ordenó a Guo Shoujing "inspeccionar la sección del río que conecta Wen y Si desde las dinastías Song y Jin" para prepararse para la reapertura del canal.
Cuando se abrió por primera vez el Canal Yuan, el volumen de transporte no era muy grande y el trabajo de gestión estaba relativamente disperso. En la dinastía Yuan, la gestión de los canales y la conservación nacional del agua estaba subordinada al director del Ministerio de Obras. Después de la finalización del río Huitong, primero se estableció que la conservación del agua estaba supervisada por Jingdezhen (Zhangqiu), y luego Jining y Yuncheng supervisaban la conservación del agua, y la vía fluvial de Xuzhou a Linqing y el río Amarillo en Henan. y Shandong fueron administrados. Además de proteger las puertas de la ciudad, también se utilizaron algunas tropas para gestionar los canales y mantener el orden.