Se ha encontrado que más de 30 especies de microorganismos secretan queratinasa. Estos microorganismos provienen principalmente de hongos, actinomicetos y bacterias, como el dermatofito y Cnadina albicans entre los hongos), Streptomyces entre los actinomicetos, Bacillus licheniformis y Bacillus. subtilis entre bacterias, etc. Los hongos fueron los primeros microorganismos descubiertos que producían queratinasa. Ya en 1899, Ward informó que Onygena equina podía descomponer la queratina. Muchos microorganismos dermatofitos tienen la función de producir queratinasa, incluidos Trichophyton mentagrophytes, Doratomyces microsporus [12], Trichophyton rubrum, Trichophyton de aves de corral, Microsporum gypseum, Microsporum canis y Monilia albicans, Aspergillus flavus, Oidium tropioale, Candida parapsilosis, Candida krusei, etc. Después de que los dermatofitos se adhieren a la piel, primero usan queratinasa para degradar la cutina de la piel. Después de la degradación, se producen varios péptidos cortos y aminoácidos, que sirven como fuentes de carbono y nitrógeno para el crecimiento de hongos. Luego invaden aún más la piel para reproducirse e infectarse, lo que lleva a la formación de enfermedades de la piel. En la actualidad, se han llevado a cabo cada vez más algunas investigaciones sobre hongos patógenos, que también han desempeñado un papel positivo en el mecanismo de degradación de la queratina y la investigación relacionada.
Además de los dermatofitos, existen algunos otros hongos que tienen la función de degradar la queratina. Anbu et al. (2004) descubrieron una especie de Scopulariopsis brevicaulis que tiene la capacidad de producir queratinasa, y aislaron y purificaron esta queratinasa. Singh et al. estudiaron 21 especies de hongos productores de queratinasa y descubrieron que Trichophyton simii tenía la mayor capacidad para degradar la queratina de las plumas. Luo Wen et al. aislaron un moho del suelo que puede degradar la queratina de la harina de plumas y lo identificaron inicialmente como Catenularia sp. Santos informó el aislamiento de Aspergillus fumigatus que degrada la queratina de las plumas y puede crecer utilizando la queratina de las plumas como única fuente de carbono y nitrógeno. En la actualidad se han cribado y aislado muchas bacterias que pueden degradar la queratina, principalmente Bacillus. Williamsh et al. (1989) enriquecieron y aislaron bacterias que descomponen las plumas del caldo de fermentación de plumas de aves y las identificaron como Bacillus licheniformis termófilo. Las condiciones son óptimas. Adecuado para el crecimiento, pero las plumas que no han sido cocidas al vapor a altas temperaturas no pueden degradarse. Otras especies de Bacillus incluyen Bacillus pseudofirmus, Bacillus subtilis, Bacillus pumilus, etc. Además, las bacterias con actividad queratinasa incluyen bacterias anaeróbicas termófilas, Vibrionaceae, Flashbacter islanda, Chryseobacterium, etc.
Las bacterias crecen rápidamente, son fáciles de reproducir, tienen una alta actividad de producción de enzimas y tienen propiedades específicas como la temperatura óptima y el valor de pH de la queratinasa, que tienen un buen potencial de aplicación.