La Universidad de Tsinghua depende directamente del Ministerio de Educación de la República Popular China, clasificada como "Proyecto 211", "Proyecto 985" y seleccionada en el "Plan Everest", el "Proyecto 2011" y "Proyecto 11". Es miembro de la Alianza C9, la Asociación de Universidades de Investigación de Asia Oriental, la Alianza de Universidades de la Cuenca del Pacífico y la Alianza Universitaria de Energía Baja en Carbono Tsinghua-Cambridge-MIT, y se ha establecido a nivel viceministerial.
Al 31 de marzo de 2065438, la Universidad de Tsinghua opera 322 instituciones de investigación científica, incluidas 123 instituciones de investigación científica aprobadas por departamentos gubernamentales, incluido 1 laboratorio nacional (por construir), 1 infraestructura científica y tecnológica importante, y 2 centros nacionales de instrumentos científicos a gran escala.