En octubre de 1982, el Comité Municipal del Partido de Mudanjiang decidió establecer la Universidad de Mudanjiang en la quinta reunión ampliada del noveno comité plenario. En julio de 1983, la Oficina de Educación Superior de la provincia de Heilongjiang aprobó el establecimiento de la Universidad de Mudanjiang. Cuando se fundó por primera vez, la Universidad de Mudanjiang no tenía campus, ni financiación, ni profesores ni equipamiento. En las condiciones de oficina móvil, el primer equipo directivo de la escuela adoptó el modelo de gestión escolar encomendado. Más de un mes después de su creación, ha reclutado a 121 estudiantes universitarios con especialización en teñido y acabado de textiles, moldeado de plástico y síntesis orgánica e ingeniería química, y se ha puesto en contacto activamente con la Oficina de Industria Química, Empresas de Plásticos y la Oficina de Luz Secundaria. Industria para firmar contratos de trabajo.
En agosto de 1984, la Universidad de Mudanjiang se fusionó con la Escuela del Cuadro Administrativo Municipal. En agosto de 1985 se completó el nuevo edificio de enseñanza de la escuela y tuvo su propio edificio escolar, despidiéndose de la historia de la encomienda, el préstamo de tierras y la educación conjunta.
En junio de 1986, el gobierno municipal de Mudanjiang decidió fusionar la Universidad del Personal Municipal con la Universidad de Mudanjiang. En mayo de 1991, la Universidad de Radio y Televisión de Mudanjiang se fusionó con la Universidad de Mudanjiang. El 10 de junio de 2010 se inició la construcción del Campus Hailin, con una superficie total prevista de 500.000 metros cuadrados. En octubre de 2011, se completó e inauguró oficialmente el campus de Hailin. El 15 de noviembre de 2012, la Universidad de Mudanjiang solicitó ser ascendida a una institución de pregrado aplicada y fue aprobada por el gobierno provincial de Heilongjiang para ser incluida en el "Duodécimo Plan Quinquenal" nacional. El 5 de agosto de 2019, se llevó a cabo en la Escuela de Salud de Mudanjiang la ceremonia de establecimiento e inauguración de la Escuela de Atención Médica de la Universidad de Mudanjiang. El establecimiento de esta universidad puso fin a la historia de Mudanjiang sin una escuela de medicina.