En la actualidad, la Universidad de Xinjiang cuenta con la Escuela de Política y Administración Pública, la Escuela de Economía y Gestión, la Escuela de Derecho, la Escuela de Humanidades, la Escuela de Periodismo y Comunicación, la Escuela de Lenguas Extranjeras, la Escuela de Matemáticas y Sistemas. Ciencias, Facultad de Ciencias Físicas y Tecnología, Facultad de Química e Ingeniería Química, Facultad de Ciencias de la Vida, Facultad de Ciencias y Tecnología, Facultad de Recursos y Ciencias Ambientales, Facultad de Ciencias e Ingeniería de la Información, Facultad de Ingeniería Mecánica, Escuela de Ingeniería Eléctrica, Escuela de Ingeniería Arquitectónica, Escuela de Textil y Confección, Escuela de Turismo, Escuela de Idiomas y Escuela de Software.
La Universidad de Xinjiang comenzó a reclutar estudiantes de posgrado en 1978. Después de 1981, la universidad obtuvo el primer lote de derechos de concesión de títulos de maestría. En 1996, la Oficina de Títulos Académicos del Consejo de Estado lo aprobó como unidad autorizadora de títulos de doctorado y programa de doctorado en lenguas y literatura minoritarias chinas. La escuela de posgrado de esta escuela tiene ocho disciplinas: filosofía, economía, derecho, literatura, historia, ciencias, ingeniería y administración, pero no hay educación.
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