La Universidad de Hong Kong es miembro de la Alianza Universitaria de la Cuenca del Pacífico, la Alianza Pine, Universitas 21, la Asociación de Presidentes de Universidades Chinas, la Alianza Universitaria Guangdong-Hong Kong-Macao, la Alianza Universitaria Beijing-Hong Kong University Alliance, la Alianza Universitaria Shanghai-Hong Kong y miembro de AACSB y EQUIS.
De 2012 a 2013, el Consejo de Becas de Investigación asignó un total de 10,88 millones de dólares de Hong Kong a la Universidad de Hong Kong. Durante el mismo período, el Comité de Becas Universitarias de Hong Kong asignó 11,96 millones de dólares de Hong Kong a la Universidad de Hong Kong como subvención de investigación, y el gobierno de Hong Kong asignó 1,23 millones de dólares de Hong Kong. Además, la Universidad de Hong Kong ha firmado contratos de investigación con varias instituciones locales y extranjeras. En 2013, el valor total del contrato alcanzó los 830 millones de dólares de Hong Kong.