Sin Martin Chalfie, la proteína verde fluorescente parece ser sólo un "subproducto" de la investigación científica. Shimomura publicó un artículo sobre la proteína verde fluorescente en 1972, y Charfe no escuchó el término hasta 1988 durante una conferencia en la Universidad de Columbia. Antes, durante muchos años, había estado estudiando la estructura neuronal de un gusano llamado Nematode elegans, que mide sólo 1 milímetro de largo. Este nematodo está formado por 959 células, pero tiene cerebro, sexo y vida útil. Si Shimomura es la partera de la proteína verde fluorescente, entonces Scharfi es el descubridor del valor de la proteína verde fluorescente. Sin embargo, el "encuentro" de Charfe con la proteína verde fluorescente tuvo un elemento de suerte.
Charfe era muy consciente de que la proteína verde fluorescente podría convertirse en una herramienta mágica para estudiar los nematodos. Después de años de investigación, Charfe publicó el artículo "Green Fluorescent Protein as a Genetic Marker" en la revista estadounidense "Science" en 1994. Aunque el texto tiene sólo una página, indica que la proteína verde fluorescente se ha utilizado en aplicaciones de laboratorio.
Después de que se anunció el Premio Nobel de Química de este año, algunos internautas en la sección de biología del "Foro Weiming" de la Universidad de Pekín creyeron que Chaffee había conseguido un gran negocio y que la proteína verde fluorescente era sólo una herramienta para él. estudiar nematodos. En su opinión, el ex investigador del Laboratorio de Biología Marina Woods Hole, Douglas Prasher Beauchard Fee, era más merecedor del premio.
Después de que Shimomura descubriera la proteína verde fluorescente, Prasher descubrió el gen que podría usarse para clonar la proteína verde fluorescente. Tsien recordó una vez que tanto él como Scharf se beneficiaron de Prascher, quien les proporcionó el gen de forma gratuita.
Prascher no se arrepiente de haber proporcionado genes a Chaffee y Tsien. Dijo que la pareja hizo un gran esfuerzo. En ese momento sufría de falta de fondos y temía no poder sobrevivir.
Después de dejar el Laboratorio Woods Hole por razones financieras, Prasher se transfirió a un laboratorio afiliado al Departamento de Agricultura de Estados Unidos y al Departamento de Aeronáutica y Astronáutica de Estados Unidos. La NASA rescindió su contrato hace dos años y medio. Prasher ahora trabaja como vendedor de automóviles en Alabama.
Charfe fue elegido miembro de la Academia Nacional de Ciencias en 2004.