Según las estadísticas del Ministerio de Educación, Cultura, Deportes, Ciencia y Tecnología, en Japón hay 86 universidades nacionales, 86 universidades públicas y 603 universidades privadas, lo que representa 775 del total de universidades. A juzgar por el número de estudiantes, las universidades públicas chinas representan sólo el 5% del total debido al pequeño número de escuelas, la estricta inscripción y las bajas tasas de matrícula.
Debido a que las clasificaciones universitarias mundiales se basan principalmente en la investigación académica, las universidades en países con instituciones de investigación tienen muy buenas clasificaciones y reputaciones mundiales. Las diez primeras clasificaciones académicas de la Universidad Jiaotong en Japón son todas universidades públicas. Sin embargo, las universidades privadas tienen una ligera ventaja a la hora de encontrar empleo en Japón debido al gran número de graduados en la sociedad.