En 2007, Shenhua, que sufrió tres derrotas y un empate, se convirtió en espectador de la Liga de Campeones de la AFC. Con 1 punto en cuatro rondas, estableció un récord para el primer equipo chino en ser eliminado en la liga. Historia de la Liga de Campeones AFC. En 2009, el Grupo Shenhua era fuerte. Después de perder ante Kashima Antlers, derrotaron a Suwon Samsung, pero después de tres juegos no lograron ganar y fueron eliminados del grupo.
Récord del Shenhua en la Liga de Campeones AFC
El Shanghai Shenhua es un visitante frecuente de la Liga de Campeones AFC, pero sus resultados no han mejorado significativamente. En la temporada 2002-2003, el primer año de la reestructuración de la Liga de Campeones de la AFC, Shenhua perdió ante el equipo anfitrión BEC Sasa en Tailandia al final del primer partido, quedando tercero en el grupo. En 2004, el Shanghai Shenhua participó por primera vez en la Liga de Campeones de la AFC tras su reestructuración y se convirtió en el último campeón de la Liga de Campeones de la AFC. Como resultado, Shenhua perdió tres juegos seguidos y fue eliminado temprano. En la temporada 2006, el Shanghai Shenhua, que volvió a participar, quedó clasificado en el Grupo G y avanzó por primera vez a los cuartos de final de la Liga de Campeones AFC. Luego, Shenhua derrotó al Jeonbuk por 1-0 en casa, pero fue eliminado por 2-4 fuera de casa.