La ingeniería de separación biológica es una parte importante de la biotecnología. Su tarea fundamental es diseñar y optimizar el proceso de separación, mejorar la eficiencia de la separación y reducir los costos del proceso. El desarrollo de nuevas tecnologías, nuevos medios y nuevos equipos de alta capacidad, alta velocidad y alta resolución es el principal objetivo del desarrollo de la ingeniería de separación biológica.
Definición de ingeniería de separación biológica: proceso de separación y purificación de productos biológicos a partir de caldo de fermentación o fluido de reacción enzimática o fluido de cultivo de células animales y vegetales.