Actualmente existen dos teorías comunes en fisiología vegetal:
1. Teoría del crecimiento ácido: la auxina se une a los receptores y promueve aún más la activación de la bomba de protones a través de la transducción de señales, transfiriendo protones (H) es descargado a la pared celular Cuando el entorno de la pared celular se acidifica, los enlaces lábiles al ácido (como los enlaces de hidrógeno) en la pared celular se rompen. Al mismo tiempo, algunas enzimas en las células se activan y la pared celular se relaja. provocando que el potencial de presión de la célula disminuya y provocando que la célula colapse. El potencial hídrico disminuye, las células absorben agua y el volumen aumenta y se produce un crecimiento irreversible.
2. Teoría de la activación genética: cuando IAA. se une a la proteína receptora de hormonas en la membrana plasmática (posiblemente la bomba de protones en la membrana plasmática), activa el segundo mensajero en la célula y transduce la información al núcleo, desreprimiendo el gen inhibido, iniciando la transcripción y traducción del gen. sintetizando nuevos ARNm y proteínas, proporcionando materias primas para la síntesis de citoplasma y pared celular, y esto produce una serie de reacciones fisiológicas y bioquímicas.