Después de escapar de Raccoon City, Jill continúa su campaña global para detener el terrorismo.
En 2003, tras la Operación T-A.L.O.S., Jill y Chris se convirtieron en uno de los primeros 11 miembros en unirse a la BSAA durante su período de fundación. Todavía están luchando contra las armas biológicas y el bioterrorismo en todo el mundo.
Chris y Jill impidieron el desarrollo de armas biológicas y químicas en Asia, destruyeron laboratorios de armas biológicas y químicas en América del Sur y arrestaron a algunos traficantes de armas de contrabando en Europa. Quieren erradicar las armas químicas y biológicas. Todos sospecharon que Umbrella estaba detrás de estas operaciones, pero no encontraron pruebas concluyentes.
En la batalla con Wesker, Wesker mostró su fuerza y habilidad más allá de la gente común. Aunque los dos tenían experiencia, fueron derrotados por el extraordinario Wesker. Cuando Wesker estaba a punto de matar a Chris, Jill se arrojó sobre Wesker y cayó por el acantilado con su antiguo enemigo. Y Chris sólo pudo observar impotente cómo su compañero y su enemigo perecían juntos. Más tarde, la BSAA envió un equipo de búsqueda a gran escala para buscar y rescatar a Jill, pero no se encontró ningún rastro de Jill.
El 23 de noviembre de 2006, Jill Valentine fue declarada oficialmente muerta. Su nombre fue incluido en la lista BSAA de personas muertas en el cumplimiento del deber.
Información ampliada:
Seguimiento——
Después de que Jill se cayó del acantilado, ni Jill ni Wesker murieron. Jill recibió un fuerte golpe y perdió el conocimiento. Wesker rescató a Jill. Después de darle a Jill el tratamiento necesario, Wesker la puso en una cámara de hibernación criogénica. Una vez que se completa el Proyecto Uroboros, Wesker se prepara para usar a Jill como su primer experimento, que es la forma de venganza de Wesker.
Sin embargo, la diosa de la suerte todavía favorecía a Jill esta vez. Los órganos vitales detectaron algunos cambios inusuales en sus signos de vida, y se estaban produciendo cambios en el cuerpo de Jill. Wesker sentía mucha curiosidad al respecto y investigaciones posteriores demostraron que había una variante del virus T en el cuerpo de Jill. Es un resto de cuando se infectó en Raccoon City. Originalmente, el suero en ese momento debería haber eliminado todos los virus, pero en ese momento solo provocó que el virus entrara en un estado inactivo y ahora el virus ha brotado nuevamente.
Poco después de que el virus T reviviera, desapareció mágicamente, pero el virus también dejó algo atrás. Wesker descubrió que Jill era muy resistente al virus. Sin embargo, esto no es un milagro a corto plazo, sino que debido a que el virus ha existido en el cuerpo de Jill durante mucho tiempo, su cuerpo ha establecido un sistema de defensa. Este descubrimiento amplió aún más las ambiciones de Wesker.
Después de que se eliminó la amenaza de P30, Jill y Josh Stone, el capitán del equipo Delta de la rama africana de BSAA, escaparon con éxito y condujeron un helicóptero hasta el lugar del accidente del volcán para rescatar a Chris Redfield y Xie Wa. Aloma brinda apoyo.
Debido a que el virus Uroboros se deriva de la planta ancestral (la flor utilizada por la tribu Nidipaya en las ceremonias) y es altamente tóxico para los humanos, los humanos a menudo mueren incluso antes de comenzar a evolucionar. Wesker creía que los anticuerpos del cuerpo de Jill podrían hacer que el virus fuera menos virulento. Mantuvo viva a Jill para poder extraer los anticuerpos.