Godzilla fue originalmente la especie principal que vivía en el Pérmico. Al final de la extinción masiva del Pérmico, ha estado en silencio en las profundidades del mar desde que derrotó a la pareja Muto en la última película. Godzilla persigue a Ghidorah después del regreso del invasor alienígena. En la primera batalla, la Antártida perdió ante Dragon. En la segunda batalla naval, Godzilla le arrancó de un mordisco una de las cabezas a Ghidorah, pero resultó gravemente herido por el "Destructor de Oxígeno" humano y se hundió en las profundidades del mar. Con la convocatoria de Mothra y la adición de bombas nucleares humanas, se hizo a la mar nuevamente, pero aun así perdió ante Ghidorah. Al final, Mothra la intensificó y entró en el estado de loto rojo.
Mothra era originalmente la santa patrona de Infant Island. La "reina monstruo" que simboliza la "maternidad". Miden sólo 15,8 metros de altura, pero tienen una envergadura de 244,8 metros. Sus alas pueden emitir una luz cegadora agresiva, lo que les otorga el superpoder de "destrozar el cielo". En China y Yunnan se convirtió en mariposa. Luego fue a llamar a Godzilla que se estaba hundiendo en las profundidades del mar. Después de derrotar a Rodon, Mothra, que resultó gravemente herido, se enfrentó resueltamente a Guidorah y finalmente se sacrificó.
Ghidora es un monstruo de otro planeta. Antiguos murales registran la larga y feroz batalla entre este dragón de tres cabezas y Godzilla. Ya congelado en la Antártida. La altura es de 158,8 metros y la longitud de las alas es de unos 400 metros. Godzilla también parece diminuto delante de él. Es poderoso no sólo puede escupir rayos gravitacionales, sino que también es inteligente y astuto. Provoca relámpagos y truenos dondequiera que vaya. Su capacidad para decapitar y regenerarse le permite "matar sin cesar". Una vez aplastado Godzilla.
Ratón mide unos 47 metros de altura y una envergadura de unos 265,5 metros. Ratón, un "monstruo forjado en fuego", se despierta del volcán como un pterosaurio gigante con chispas volando de sus alas. Las tormentas y explosiones sónicas provocadas por su vuelo causaron devastación dondequiera que fuera. Mientras perseguía a un guerrero humano, conoció a Guidorah y, tras perder, se convirtió en su peón. En la batalla final, Guidorah lo convocó para contener a Mothra, pero resultó gravemente herido por la punta de la cola de Mothra. Después de ser destruida, Kaidorah se rindió a Godzilla.