Análisis de secuencia de ADN-orffinder (dirección de la página de inicio de NCBI/gorf/gorf.html)
Otros sitios web funcionales son:
Base de datos NCBI-GenBank
p>Búsqueda de similitudes en bases de datos: comparación de secuencias de ácidos nucleicos y base de datos de ácidos nucleicos (BLASTN)
Comparación de secuencias de proteínas y secuencias de proteínas en la base de datos (BLASTP)
Alinear las dos secuencias.
——GENSCAN, analizando la parte exón de la secuencia experimental
——Se analizó un posible sitio de restricción Neb Cutter 2.0 de la secuencia experimental.
Base de datos de enzimas de restricción-rebase
Diseño de cebador de amplificación-secuencia experimental de Fisher del gen
Cebador 3
Análisis de secuencia de proteínas y predicción de estructura;
Predecir el peso molecular y el punto isoeléctrico de las proteínas: ExPASy (calcular pI/Mw).
Analizar las propiedades físicas y químicas básicas de las proteínas: ExPASy(ProtParam).
Análisis de hidrofilicidad e hidrofobicidad de proteínas: ExPASy (ProtScale)
Análisis de los productos finales de proteínas tratadas con diversas proteasas y reactivos químicos: ExPASy (masa peptídica).
Análisis de péptidos señal de proteínas: expasa(SignalP)
Predicción de la estructura secundaria de proteínas
Análisis filogenético de sistemas moleculares multiespecies: EMBL EMBL - Caja de herramientas - Clustal2W
Secuencia proteica de la adiponectina humana: NP_004788
Precursor del factor de crecimiento insulínico humano IB: P05019