Cuando Jason descubrió que Batman no se había vengado, se enfureció y juró vengarse de él. Intencionalmente usó una capucha roja (pero no un esmoquin), que era el atuendo de la pandilla a la que se unió el Joker. Disfrazado de Capucha Roja, regresa a Gotham City para luchar contra Batman y Nightwing. Atrapó al Joker y lo golpeó de la misma manera que antes, pero en lugar de matarlo, quería usarlo contra Batman. Jason controlaba algunas pandillas y atacó a Black Mask, la pandilla más grande de Gotham City, tratando de hacer que todos los criminales se mataran entre sí. Atacó a Robin Tim III por celos, pero lo dejó ir porque admiraba su coraje. Batman finalmente descubrió que Jason había resucitado y quiso persuadirlo para que regresara, diciendo que no mató al Joker para no violar sus principios. Jason propone un duelo. Si Batman no puede matarlo, matará al Joker. Finalmente, Batman detuvo a Jason (puedes ver la historia completa en la película animada "Batman vs. Red Hood", pero es un poco diferente a los cómics), y sucedió en 2005.
En el evento "Crisis Infinita" de 2006, Batman murió y Jason participó en duras actividades contra el crimen como Nightwing y Red Hood. En "Countdown to Final Crisis" de 2007, él y varios otros viajaron a través de múltiples mundos paralelos en busca del héroe desaparecido Atom, y finalmente llegaron a la "Tierra 51". Allí, Jason descubrió que el mundo entero era pacífico, solo había héroes y ningún villano. Invasores de otros mundos asaltaron la Tierra 51. Los héroes que estaban acostumbrados a vivir en paz fueron tomados por sorpresa y asesinados uno tras otro. Jason encontró a Batman en la Baticueva aquí, y después de enterarse de que fue asesinado en el propio mundo de Jason, se vengó extremamente, eliminando a todos los Super Criminal 51 en la Tierra y alienando a otros héroes. Jason lo animó a salir y pelear, y le dieron un traje diseñado para su asistente, pero no tuvo tiempo de usarlo: Red Robin.
Después de una feroz batalla, Batman murió a manos de la versión malvada de Superman en "Tierra 3". Un Joker de otro mundo paralelo pisotea el cuerpo de Batman y Jason lo mata sin avisar a sus compañeros. Después de regresar al mundo principal, Jason abandonó el equipo de Red Robin y continuó su carrera criminal de luchar contra la violencia con violencia, volviéndose más seguro que antes.
Después de la crisis final, Batman en el mundo principal "murió". En la Batalla de las Capas, Jason una vez se puso la capa y su propio disfraz de "Batman", y comenzó a castigar a los criminales en Gotham City que se volvieron más arrogantes después de que Batman se fue, y le dijo a Dick que Batman estaba muerto y que él Conviértete en un nuevo Batman que es más eficiente que Bruce y no tiene miedo de matar. Compite con Dick, Tim y otros por el "trono de Batman". Para detener a Jason, Dick le mostró un mensaje en video ("Últimas palabras") dejado por Bruce: dijo que era un error dejar que Jason fuera su asistente y se involucrara en sus propias batallas. Aunque siempre había sabido que Jason tenía un trauma mental severo, no podía resolverlo fundamentalmente. Convertirse en Robin sólo le dio una salida, pero alimentó su ira. Siempre se sintió extremadamente culpable por no ayudar a Jason, y sugirió que Jason debería buscar terapia... Al verse frustrado, Nightwing estaba decidido a tomar el mando y convertirse en el nuevo Batman. Jason, quien fue derrotado y escapó, comenzó sus actividades nuevamente poco después de usar la identidad de Caperucita Roja (y trajo como asistente a una chica que fue víctima del profesor Pig Noodles), pero luego se enfrentó a la loca venganza del pervertido asesino Flamingo. y... Damian resultó gravemente herido y finalmente cayó en manos del Jefe Gordon, quien estaba fuertemente encarcelado en Arkham.
Más tarde Bruce Wayne resucitó y conoció a Jason en la prisión de Arkham. Posteriormente, Jason fue trasladado de Arkham a una prisión regular por un período de tiempo.
Mientras estaba en prisión, fue trasladado de nuevo a Arkham debido a numerosos problemas provocados por conflictos con otros criminales. En el camino, fue secuestrado por un grupo de misteriosos mercenarios y logró escapar de la prisión. Sólo entonces supo que la líder de estos mercenarios, una mujer misteriosa, estaba secuestrando a su antiguo compañero Xue como amenaza para salvar a Xue. Una vez más se puso Capucha Roja y formó una sociedad temporal con Dick y Damian, que todavía eran Batman y Robin. Después de algunos giros y vueltas, rescató con éxito a Bloodstain y escapó con ella de Batman y Robin. Al final de la historia, Batman y Robin V1 desaparecieron. Después de que se reinició el New 52, se convirtió en socio cercano de Red Arrow y Spark, y los tres formaron un equipo llamado Extralegal y establecieron una fuerte amistad. Una vez apareció en "Batman Heroes" como un compañero, luchando junto a los miembros de los héroes. Fue secuestrado por el Joker durante el incidente del "genocidio" y luego fue quemado con el ácido de la máscara en la trampa mortal del Joker, dejándolo en estado crítico. En la historia de Red Hood y Outlaw, perdió y recuperó brevemente la memoria, derrotó a Ra's al Ghul y se separó de sus amigos al final de la historia. A juzgar por el ramal "Doomsday Future", muestra que ha estado luchando contra criminales de todo el mundo como Red Hat durante los próximos cinco años.