Agilent es más grande.
Shimadzu tiene el precio más bajo y es el más común; Agilent tiene un precio medio y Waters tiene un precio ligeramente superior.
Personalmente recomiendo Agilent. El precio es una de las razones y el equipo también es bastante bueno. Especialmente los instrumentos de la serie 1200 son fáciles de operar, fáciles de usar y muy duraderos.
Es difícil empezar con los instrumentos de Waters, tal vez porque soy un poco estúpido y nunca he podido adaptarme a su interfaz. Sin embargo, sus funciones siguen siendo bastante potentes, pero el precio es elevado.