El Ubiquitin Proteasome System UPS (Ubiquitin Proteasome System) es un mecanismo de control de calidad de proteínas intracelulares que conecta de manera valenciana las moléculas de ubiquitina con las proteínas de desecho, indicando así la necesidad de degradarlas, y finalmente degradadas por el proteosoma. Los siguientes son varios métodos que se pueden utilizar para detectar el sistema de proteasoma ubiquitinado:
Western Blotting: método para detectar el sistema de proteasoma ubiquitinado, principalmente mediante la detección de proteínas específicas en muestras de proteínas. El nivel de modificación de ubiquitina del sistema. La proteína objetivo se puede utilizar para determinar indirectamente el nivel de ubiquitinación y el nivel de degradación de proteínas en las células.
Tecnología de etiquetado de isótopos estables: tecnología que utiliza etiquetas de isótopos estables (como metabolitos de deuterio) entre los niveles de expresión de proteínas para análisis cuantitativos. Al comparar muestras marcadas con isótopos con muestras de control, se puede determinar con precisión la cantidad de proteína degradada por el proteosoma y el grado de ubiquitinación.
Sondas Fluorescentes: Una tecnología de detección basada en moléculas fluorescentes que observa y cuantifica directamente los cambios en los niveles de ubiquitinación intracelular conectando sondas fluorescentes a ubiquitina o proteínas de desecho.
Inmunoprecipitación: método de detección que combina inmunología y análisis químico para capturar selectivamente proteínas ubiquitinadas o sus parejas que interactúan e identificarlas y analizarlas mediante tecnología de espectrometría de masas.
Los métodos anteriores se pueden utilizar para detectar el sistema de proteasoma de ubiquitinación y se pueden seleccionar diferentes métodos según las diferentes necesidades experimentales.