En cuerpos de agua contaminados, los jacintos de agua se multiplican rápidamente, formando una única alfombra densa, lo que reduce significativamente la transmisión de luz del cuerpo de agua, limitando así la fotosíntesis del fitoplancton, las plantas sumergidas y las algas en el cuerpo de agua, y aumentando la diversidad de plantas acuáticas. . Al mismo tiempo, los animales y plantas en el agua consumen una gran cantidad de oxígeno y aumentan el contenido de dióxido de carbono. El crecimiento y reproducción de Eichhornia crassipes aumenta el humus en el agua, reduce el valor del pH y cambia el color del agua. Debido al aumento de la biomasa de Eichhornia y las densas esteras de pasto, la velocidad del flujo de agua se reduce y los restos de plantas no degradadas en el fondo del río aumentan y se depositan gradualmente en el cuerpo de agua, lo que provoca que el lecho del río se abulte. Los cambios en los factores físicos y químicos del agua, especialmente la reducción del contenido de oxígeno en el agua y la reducción de los lugares submarinos de reproducción de plantas y animales, conducirán a una disminución de la diversidad de animales en el agua. Sin embargo, Masifwa et al. compararon la comunidad de jacintos de agua en el lago Victoria, Uganda, y descubrieron que la diversidad de invertebrados acuáticos mostraba una tendencia a la baja desde aguas abiertas cercanas a la comunidad de jacintos de agua hasta comunidades de juncia cerca de la costa. Creen que Eichhornia crassipes aumenta la diversidad de invertebrados acuáticos en aguas abiertas. También estableció un modelo del ancho óptimo de las poblaciones de Eichhornia crassipes que crecen en la costa en un intento de aumentar la diversidad de animales acuáticos. Bailey y Litterick sugirieron que cuando los jacintos de agua tienen densidades más bajas, la diversidad de animales acuáticos puede aumentar, pero cuando los jacintos de agua aumentan en densidad, la diversidad de animales y plantas acuáticas disminuye.
El crecimiento denso de Eichhornia crassipes en los cuerpos de agua a menudo conduce a una disminución de las plantas acuáticas sumergidas. Sin embargo, debido a su sedimentación masiva durante muchos años, el limo del lecho del río se ha profundizado y han surgido plantas acuáticas como juncos y. El arroz silvestre ha aumentado significativamente. Al mismo tiempo, estas plantas emergentes pueden prevenir la deriva de Eichhornia crassipes, permitiéndoles asentarse en grandes cantidades y reproducirse y crecer rápidamente. Los dos se complementan, afectando en gran medida el paisaje fluvial y bloqueando el río.
Debido a la invasión del jacinto de agua, la estructura inherente de la cadena alimentaria del ecosistema fluvial local ha cambiado, afectando el crecimiento y la reproducción normales de los peces. En algunos ríos y lagos de África hay suficiente oxígeno y alimento cerca de la vegetación de las riberas y en aguas abiertas, que son lugares donde muchos peces se reproducen, crecen y habitan. Sin embargo, la invasión del jacinto de agua a menudo dificulta la migración de los peces, afectando así la reproducción, alimentación y crecimiento de los peces juveniles.