Después de la victoria de la Guerra Antijaponesa, la Universidad Nacional de Pekín, la Universidad Nacional de Tsinghua y la Universidad privada de Nankai se desmovilizaron y regresaron al norte. El Colegio Normal de la Universidad Nacional Asociada del Suroeste se estableció de forma independiente en Kunming y pasó a llamarse "Colegio Normal Nacional de Kunming". El campus está ubicado en la sede de la National Southwest Associated University. Después de la fundación de la Nueva China, pasó a llamarse Universidad Normal de Kunming. En 1984, la Universidad Normal de Kunming pasó a llamarse Universidad Normal de Yunnan.
El 7 de julio de 1937, el imperialismo japonés lanzó el Incidente del Puente Marco Polo y estalló la Guerra Antijaponesa de manera generalizada. Para preservar el sustento educativo y cultural de la nación china, tres famosas universidades del norte, la Universidad Nacional de Pekín, la Universidad Nacional de Tsinghua y la Universidad privada Nankai, originalmente ubicada en Pingjin, se vieron obligadas a trasladarse al sur, a Changsha, Hunan. para formar la Universidad Nacional Temporal de Changsha. Pronto, Nanjing cayó y el ejército japonés avanzó río arriba. Wuhan fue sacudido y Changsha estuvo en peligro. La Universidad Temporal de Changsha se vio obligada a trasladarse al oeste, a Yunnan, y llegó a Kunming en abril de 1938. El Ministerio de Educación la rebautizó como Universidad Nacional Asociada del Suroeste.