Después de la división de medicina, la Universidad Nacional de Wuhan ha estado trabajando duro para hacer realidad los ideales del presidente Wang Shijie y establecer una universidad con 10.000 personas de seis facultades: "Derecho, Ciencias, Ingeniería, Agricultura y Medicina". Finalmente, tras la victoria de la Guerra Antijaponesa y el mismo año de la desmovilización de la montaña Luojia (1946), el Ministerio de Educación del Gobierno Nacional aprobó el establecimiento de una escuela de medicina en la Universidad de Wuhan con 19 disciplinas entre ellas anatomía y farmacología. El famoso farmacólogo Zhou fue el primer decano (y decano del hospital afiliado). En 1950, la Facultad de Medicina se fusionó con la Facultad de Medicina de la Universidad de Tongji para formar la Facultad de Medicina Central South Tongji (ahora Facultad de Medicina Tongji de la Universidad de Ciencia y Tecnología de Huazhong).
Aunque no existe un desarrollo especializado de las disciplinas farmacéuticas, la investigación sobre medicamentos nunca ha sido interrumpida en la historia de la Universidad de Wuhan. Ya cuando se mudaron al oeste, a Leshan (1938), los estudiantes de química Peng (más tarde académico de la Academia de Ciencias de China), Tu y otros extrajeron y refinaron la medicina tradicional china Nux vomica para tratar enfermedades locales. Fang Cheng, un famoso caricaturista, también estudia farmacia en el Departamento de Química de la Universidad de Wuhan. Durante la Revolución Cultural, el Departamento de Biología también abrió sucesivamente nuevas farmacias (1971-1973) y biología farmacéutica (1976). En la década de 1990, a medida que la demanda de la sociedad por talentos farmacéuticos de alto nivel seguía aumentando, la Facultad de Ciencias de la Vida estableció el Departamento de Farmacia (principalmente farmacia biotecnológica) en 1994 y comenzó a reclutar estudiantes ese año. Ese mismo año, se creó el Departamento de Farmacia de la Universidad Médica de Hubei (centrado en la investigación teórica y clínica).