En 476, el Imperio Romano se dividió en Roma Oriental y Roma Occidental debido a conflictos internos y la invasión de enemigos extranjeros. El cristianismo también comenzó a dividirse en la Iglesia Ortodoxa Oriental (autoproclamada Iglesia Ortodoxa) y la Iglesia Romana. Iglesia Católica (autoproclamada Iglesia Católica). Ambas denominaciones afirman ser ortodoxias cristianas. El Papa es el líder supremo de la Iglesia Católica, mientras que el Patriarca de Constantinopla es el jefe de la Iglesia Ortodoxa. En 1054, la Iglesia Oriental y la Iglesia Occidental se anunciaron mutuamente que expulsarían a los obispos de cada una. Esto marcó la separación formal de la Iglesia Católica y la Iglesia Ortodoxa, conocida como el Gran Cisma del Cristianismo.
Con el surgimiento del Islam en el siglo VII, Jerusalén cayó bajo control musulmán. La Iglesia y el Estado de la región romana occidental llevaron a cabo ocho Cruzadas entre 1095 y 1291 para liberar Tierra Santa, Jerusalén.
En el siglo XVI se produjo la Reforma Religiosa en Alemania, Suiza, Países Bajos, el Norte de Europa y Reino Unido, dando como resultado el surgimiento de la Iglesia Protestante que se separó de la Iglesia Católica. Los líderes fueron Martín Lutero, Calvino y otros, quienes establecieron las iglesias protestante y anglicana y rompieron con el catolicismo romano. El llamado "cristianismo" en China es básicamente el protestantismo que surgió en esta época.