En marzo de 1993, la Estación de Aviación Civil de Wuyishan fue administrada de acuerdo con la jurisdicción territorial del aeropuerto, invertida y construida por el gobierno local, operada y desarrollada de forma independiente, y la aviación civil implementó la gestión de la industria. Es una estación de aviación civil local que integra control de tráfico aéreo, combustible, servicios de transporte y apoyo en tierra, con carácter empresarial y gestión corporativa. En junio de 1994, el Consejo de Estado aprobó el aeropuerto de Wuyishan como el segundo puerto nacional de aviación de primera clase en la provincia de Fujian.
La navegación aeroportuaria mejora la estructura del tráfico local. De 1994 a 2003, el aeropuerto de Wuyishan logró 10 años consecutivos de seguridad, con 32.949 vuelos seguros, 2,47 millones de pasajeros transportados y 10.954 toneladas de carga y correo. El crecimiento anual promedio de los tres índices de envío alcanzó 17,30, 22,28 y 22,28 respectivamente. Entre los más de 130 aeropuertos de aviación civil de todo el país, el tráfico anual de pasajeros siempre ha estado entre los 50 principales. Se considera uno de los aeropuertos con menor inversión, buena eficiencia y desarrollo más rápido en el este de China. También es uno de los aeropuertos regionales mejor operados del país.
El 16 de mayo de 2002, la Terminal Civil de Wuyishan y la Compañía de Servicios de Desarrollo de Aviación de Xiamen cooperaron y se reorganizaron. Ambas partes invirtieron 1,08 millones de yuanes para establecer Wuyishan Airport Co., Ltd. Con el fin de estandarizar las sociedades de responsabilidad limitada, la La nueva empresa estableció una estructura de gobierno corporativo moderna y completa. Después del establecimiento de la empresa, la empresa confió en los ricos recursos turísticos de Wuyishan para ampliar su espacio comercial. Desarrolló su negocio principal basándose en el objetivo comercial de "seguridad, calidad, integridad, innovación" y el principio de "apertura, equidad y". "imparcialidad" para garantizar la operación neutral del aeropuerto de Wuyishan. Ha sido muy elogiado tanto dentro como fuera de la industria y ha logrado buenos beneficios sociales y económicos. El aeropuerto ha abierto sucesivamente servicios desde Wuyishan a Xiamen, Fuzhou, Beijing, Shanghai, Guangzhou, Shenzhen, Dalian, Nanjing, Tianjin, Changchun, Changzhou, Hangzhou, Wenzhou, Xi'an, Wuhan, Ningbo, Jinan, Zhuhai, Haikou, Shantou. , Zhengzhou y Shenyang, Jinjiang, Zhoushan, Kunming, Hong Kong y Macao, etc. 30 rutas nacionales y regionales, el factor de carga de pasajeros promedio anual.
La nueva compañía introduce los métodos de gestión empresarial modernos, científicos y avanzados de Xiamen Airlines, se centra en la gestión interna y en el mercado externo, y promueve activamente la gestión y las operaciones básicas estandarizadas con la estandarización, los procedimientos y la institucionalización como núcleo a través del desempeño. Combinado con incentivos, activar el mecanismo de empleo, mejorar el mecanismo de distribución, fortalecer la contabilidad y el control de costos, acelerar la capacitación de los empleados, mejorar la calidad y la conciencia corporativa de todos los empleados, llevar la gestión corporativa a un camino estandarizado y estimular el entusiasmo empresarial de los empleados. En el año de fundación de la empresa, el aeropuerto obtuvo beneficios de 6,543,8 millones de yuanes.
Basándose en la planificación general del aeropuerto, la empresa aumentará la inversión en la construcción y transformación técnica del aeropuerto, y utilizará los resultados previstos como valores estándar para organizar racionalmente la escala de varias instalaciones aeroportuarias.
Mejorar gradualmente las funciones y mejorar los niveles de operación del aeropuerto mediante la introducción del sistema de certificación de calidad ISO9000, mejoraremos integralmente la calidad de la garantía del servicio, crearemos una marca de servicio con las características de la empresa y nos esforzaremos por desarrollar el mercado de la aviación de Wuyishan. Brindar servicios a aerolíneas y propietarios de carga. Los servicios de primera clase crean el mejor ambiente interno y externo.
El 28 de marzo de 2011, Xiamen International Airport Group Co., Ltd. y el gobierno municipal de Wuyishan firmaron formalmente un acuerdo. Xiamen International Airport Group Co., Ltd. invirtió 65.438,98 millones de yuanes para adquirir una participación del 65% en el aeropuerto de Wuyishan, y el 35% restante está en manos de la Terminal Civil de Wuyishan. El 31 de mayo de 2011 finalizaron los trámites de aprobación industrial y comercial para la adquisición de capital.