En 1888, la escuela pasó a llamarse Escuela Comercial de Yokohama, una escuela de cinco años (de 14 a 19 años), que reclutaba específicamente a niños.
1917 La Escuela Comercial de Yokohama se convierte en escuela municipal.
En 1921, se convirtió en la única escuela de negocios de siete años (de 12 a 19 años) de Japón. El Ministerio de Educación, Cultura, Deportes, Ciencia y Tecnología exige que las escuelas reduzcan el sistema académico a dos años, pero las regulaciones sobre las escuelas comerciales japonesas (1921) no permiten escuelas comerciales de siete años.
En 1924, la Escuela Comercial de Yokohama se convirtió en un sistema de educación especial de cinco años más dos años.
En 1928, el sistema académico especial de la Escuela Comercial de Yokohama se cambió al Colegio Comercial de Yokohama de la ciudad de Yokohama (Y College).
Después de cambiar su nombre a Yokohama City College of Economics, bajo el nuevo sistema educativo japonés, Y estudió en la Universidad de la ciudad de Yokohama en 1949. Hospital Shiquan, fundado en 1874.
Este hospital fue convertido en ayuntamiento en 1891.
En 1940, el hospital planeó establecer una escuela de medicina afiliada; después de la participación de Japón en la Segunda Guerra Mundial (1941), se volvió más decidido a establecerla.
La Facultad de Medicina Municipal de Yokohama se estableció en 1944 y el Hospital Ishizumi se convirtió en un hospital universitario.
Después de la guerra en 1947, la Facultad de Medicina Municipal de Yokohama se transformó en la universidad municipal Universidad Médica de Yokohama. En 1947 se estableció un curso preparatorio de tres años y en 1949 un curso formal de cuatro años.
La Universidad Médica de Yokohama se fusionó con la Universidad de la ciudad de Yokohama en 1952.
En 1949, la Universidad de la ciudad de Yokohama tenía un solo departamento: Negocios. En 1952, se crearon dos departamentos (Medicina y Artes y Ciencias). El estado reciente de la Universidad de la ciudad de Yokohama se detalla a continuación:
1984: se establece el Instituto de Biología Kihara.
1995-El Departamento de Artes y Ciencias se transformó en dos departamentos: el Departamento de Cultura Internacional y el Departamento de Ciencias.
2005 - Tres departamentos (Departamento de Negocios, Departamento de Cultura Internacional, Departamento de Ciencias) se fusionaron en un solo departamento: Departamento de Ciencias Generales Internacionales.