Daily-20220217-Dinámica histórica de la huella genómica de la población de ibis crestado

Mientras leía la reseña, me encontré con este documento familiar de 2019. Se puede decir que es mi trabajo esclarecedor sobre la genómica de la conservación, y también es un muy buen artículo. Publicado en Current Biology, el autor correspondiente es el profesor Zhang del Instituto de Zoología de Kunming de la Academia de Ciencias de China.

En la práctica de la biología de la conservación, ¿las medidas de conservación tienen un buen impacto en el estado genético? Esto requiere una comparación de los datos genéticos antes y después de la implementación de medidas de protección. El goral japonés es un ejemplo muy famoso en la práctica de la conservación de la vida silvestre. De sólo 7 animales recuperados en el año 2000, el trabajo de conservación ha logrado resultados notables. ¿Se ha recuperado también el estado genético del ibis crestado, cuya población inicialmente se ha recuperado? Los investigadores secuenciaron muestras históricas e individuos vivos de ibis con cresta y compararon poblaciones históricas con poblaciones vivas. Se descubrió que las poblaciones vivas habían perdido casi la mitad de su diversidad poblacional ancestral y tenían una carga de mutaciones muy severa. Además, los investigadores descubrieron que la deriva genética que acompaña a la endogamia elimina en gran medida los polimorfismos ancestrales.

El color rosa en el diagrama ABC representa muestras vivas, y el resto son muestras históricas. El NO representa el noroeste, el EA representa el este de China y el NE representa la región noreste; la muestra viva. Las poblaciones vivas no tienen una estructura poblacional obvia, mientras que los especímenes históricos exhiben diversidad.

Se estimó la dinámica histórica de estas poblaciones (PopSizeABC estima que los cambios en los últimos 10.000 años son más recientes que los del PSMC), con la tendencia a la baja más obvia en la población residencial (tenga en cuenta que el tiempo va de derecha a izquierda ). Los investigadores simularon nichos ecológicos históricos (ENM) y descubrieron que después de entrar en el último período glacial, el área adecuada para la supervivencia del ibis crestado se redujo considerablemente, lo que es consistente con la disminución de la población después de entrar en el período glacial. El área habitable actual que se muestra en la Figura B es básicamente la misma que la de la última edad de hielo (Figura C). El colapso de la población a finales del siglo XX y principios del siglo XX se debió más al impacto de las actividades humanas, lo que es consistente con la grave perturbación de los hábitats por las actividades humanas durante ese período.

En comparación con muestras históricas, los polimorfismos de un solo nucleótido en individuos vivos son muy bajos, solo alrededor de la mitad de los de los grupos históricos. También hay muchas EII en el genoma y las regiones homocigotas son amplias, lo que indica una endogamia grave. Los autores compararon el coeficiente de endogamia del ibis crestado con otras especies y descubrieron que la población superviviente tenía un coeficiente de endogamia alto, superando incluso a otras especies con tamaños de población efectivos similares.

Los investigadores también estudiaron el espectro alélico de poblaciones históricas y actuales, y los resultados mostraron que con la fuerte disminución en el tamaño efectivo de la población y la severa endogamia, muchas mutaciones dañinas se han acumulado en la población actual. Lo más probable es que esto se deba a una rápida disminución de la población, ya que la selección purificadora la eliminó demasiado tarde.

El gráfico de anillos muestra que la riqueza de alelos de la población viva es significativamente menor que la de la población histórica. También hay haplotipos más largos en personas vivas.

¿Está el ibis crestado en peligro de extinción debido a la propia especie o a la interferencia humana? Los resultados de este estudio sugieren que las poblaciones de ibis crestados deberían haberse recuperado dentro de los 10.000 años posteriores al último período glacial, pero no lo lograron. Esto puede deberse a que el propio ibis crestado ha llegado a un callejón sin salida y no se puede ignorar el impacto de las actividades humanas.

Aunque el número de ibis crestados ha aumentado, su diversidad genómica sigue siendo muy frágil y susceptible a bacterias patógenas, cambios ambientales y otros factores. Todavía queda un largo camino por recorrer para proteger al ibis crestado.