Esta película trata principalmente sobre Ultraman y la guerra para defender el Reino de la Luz. La nebulosa M78 "Tierra de la Luz" de la ciudad natal de Ultraman fue atacada por un enemigo misterioso. El joven Ultraman Zero estaba en crisis por su orgullo y complacencia.
Con la ayuda de su padre Ultraman Seven y otros guerreros, Zero pudo escapar. Avergonzado, Zero se ofreció como voluntario para ir solo a investigar la situación del enemigo. Se embarcó en un viaje al universo desconocido con el brazalete omnipotente que le regaló su padre. Después de un duro viaje, Zero llegó a un extraño planeta, donde conoció a un joven llamado Lan. Para salvar a sus compañeros, Lan resultó herido y murió en una batalla con el ejército de robots gigantes. Zero se sintió conmovido por el coraje de Lan y se asimiló a él, salvando la vida de Lan.
Sero conoció la verdadera identidad del enemigo gracias a la Princesa Esmeralda de Esmeralda. Resulta que el hombre detrás del misterioso enemigo es el emperador Beria. El malvado Ultraman Belial fue derrotado una vez por los justos guerreros Ultraman. Ahora ha resucitado y ha establecido un poderoso imperio galáctico. Tiene la intención de dominar el universo y jura vengarse de los guerreros Ultraman. Para aplastar la ambición del enemigo, Zero, el hermano de Lan, Xiaozhi, y la Princesa Emerana abordaron una nave espacial para desafiar al Imperio Galáctico.