Por favor, perdóname por los problemas que te he causado.
-Por favor, perdóname por los problemas que te he causado.
Perdón por molestarte, por favor perdóname por lo que hice.
Los cuatro métodos son posibles, pero el primero es el más formal. Cuando estaba enseñando natación en Canadá, un estudiante americano no pudo venir por algo. Me envió un correo electrónico, muy formal y genuino. ¡Espero que esto ayude!