El líder puritano C. Mather estaba profundamente descontento con la actitud cada vez más tolerante de Harvard hacia los incrédulos, por lo que animó al rico empresario británico E. Yale a donar dinero para construir una nueva escuela. Yale lleva su nombre debido a sus continuas donaciones a la escuela. El plan de estudios inicial de la escuela se centró en materias clásicas y se adhirió a puntos de vista religiosos ortodoxos. En 1828, Estados Unidos propuso que los cursos universitarios se centraran en materias prácticas en lugar de materias clásicas. El presidente de la Universidad de Yale, J. Day, publicó un informe de Yale defendiendo los cursos tradicionales. El informe siguió siendo influyente hasta la Guerra Civil, lo que ralentizó la introducción de cursos prácticos de artes liberales en las universidades estadounidenses. En 1908, la Universidad de Yale ya no exigía que los estudiantes estudiaran griego. Bajo la influencia del director A Hadley en ese momento, comenzó a centrarse en la formación profesional. La biblioteca de la universidad tiene 6 millones de libros y es una de las bibliotecas más grandes de Estados Unidos. El Museo de Arte Universitario de la Universidad de Yale, construido en 1823, tiene una rica colección y es uno de los primeros museos de arte establecidos por las universidades estadounidenses. El Museo Pippo de Historia Natural de la Universidad de Yale alberga importantes artefactos de paleontología, arqueología y cultura humana. Antes de 1969, Yale solo admitía estudiantes varones y luego se convirtió en una escuela mixta.
En 1701, un grupo de misioneros congregacionales liderados por James Pierpont persuadió a la corte de Connecticut para que aceptara el establecimiento de escuelas misioneras para permitir a los jóvenes "aprender artes y ciencias y servir a la iglesia y al país". 10 Los sacerdotes a quienes se les confió la dirección de la escuela tomaron 40 libros de su pequeña biblioteca como capital de la escuela. En junio de 1701, el clero eligió a Abraham Pearson, un graduado de la Universidad de Harvard, como primer director, y la escuela de la iglesia se estableció oficialmente. Pero no fue hasta marzo del año siguiente que la escuela tuvo su primer alumno, Jacob Hemingway. El primer grupo de 18 estudiantes recibió su licenciatura en 1707. Al principio no había escuela y los estudiantes estaban dispersos en seis ciudades de Connecticut. En 1716, los fideicomisarios votaron por unanimidad para trasladar la escuela a New Haven.
En 1718, Elihu Yale, un alto funcionario de la Compañía Británica de las Indias Orientales, donó nueve paquetes de bienes con un valor total de 562 libras, 12 chelines, 417 libros y el retrato y el abrigo del rey Jorge. de armas de I. En ese momento, fue un regalo de la Universidad de Yale en sus inicios. Para agradecer al Sr. Yale por su donación, la escuela pasó a llamarse oficialmente "Yale College", que es el predecesor de la actual Universidad de Yale. Desde la década de 1930 hasta la de 1980, con los incansables esfuerzos del obispo Berkeley, el reverendo Stiles y el presidente Porter, Yale pasó gradualmente de ser un colegio universitario a una universidad. A principios del siglo XX, con el rápido desarrollo de la educación estadounidense, la Universidad de Yale había crecido a una escala asombrosa y su influencia en el mundo había alcanzado una nueva altura.