Aunque la Facultad de Medicina de la Universidad de Pekín y la Universidad de Pekín están ubicadas en campus diferentes y tienen códigos de admisión diferentes, la Facultad de Medicina de la Universidad de Pekín todavía pertenece a la Universidad de Pekín. La institución de graduación escrita en el certificado de graduación de la Facultad de Medicina de la Universidad de Pekín sigue siendo la Universidad de Pekín.
La Facultad de Medicina de la Universidad de Pekín (PKUHSC), anteriormente conocida como Facultad de Medicina Nacional de Pekín, fue fundada el 26 de octubre de 1912. Es la primera escuela nacional de China que enseña medicina occidental por sí sola. A finales de 2017 y 2012, la Universidad de Medicina de Beijing tenía 6 facultades (departamentos), 6 hospitales directamente afiliados, 4 hospitales afiliados y 14 hospitales universitarios.