En el año 32 de Jiajing (1553), Qi Jiguang fue ascendido a gobernador de la capital, encargado de los asuntos militares de Shandong contra los piratas japoneses, y a cargo de 3 batallones y 24 centros de salud. La línea de defensa se extiende desde el cruce de Jiangsu y Shandong hasta el extremo norte de la península de Shandong. La línea de defensa costera es muy larga y la fuerza defensiva es limitada. ¿Cómo configurar las defensas? Qi Jiguang usó su cerebro e ideó un buen plan. A través de conversaciones con funcionarios locales, personas, especialmente pescadores, supo que los meses con las actividades japonesas más desenfrenadas fueron marzo, abril, mayo y septiembre de 2010. También conoció el clima general y la dirección del clima en estos meses. el viento y dónde es probable que atraque el barco. Después de descubrir los patrones de actividad del enemigo, concéntrate en establecer defensas según el tiempo y la ubicación. Al mismo tiempo, debemos rectificar el centro de salud, fortalecer el entrenamiento y mejorar la efectividad del combate con una estricta disciplina. Por tanto, la defensa costera de la provincia de Shandong se consolidó y los piratas no se atrevieron a perturbarla.
En el año trigésimo cuarto de Jiajing (1555), la invasión japonesa de Zhejiang fue grave. Qi Jiguang fue transferido a Zhejiang como general, protegiendo a Ningbo, Shaoxing y Taizhou, y dirigió el ejército para resistir a los invasores japoneses. Al ver la mala calidad del antiguo ejército, dijeron que "los soldados no tienen control, los soldados están mal entrenados, los soldados no están apegados a ellos y no conocen las órdenes militares", y son ineficaces en la lucha. Sugirió a sus superiores "reclutar nuevos soldados y entrenarse", y luego fue a Yiwu para reclutar a más de 3.000 agricultores y mineros para formar un nuevo ejército, llamado "Ejército Qijia". Después de un entrenamiento riguroso, este ejército se ha convertido en un equipo que está familiarizado con las disciplinas y regulaciones militares, domina las armas y puede librar duras batallas. Basado en las características de la ciudad acuática de Jiangnan, Yoshimitsu también reformó el sistema de colas y creó la formación del pato mandarín, que permitía que las armas largas y cortas cooperaran entre sí, y usaba armas de fuego, arcos y flechas para cubrirse, lo que representaba una gran amenaza. en la Guerra Antijaponesa. En mayo del año 40 del reinado de Jiajing (1561), los piratas japoneses reunieron cientos de barcos y más de 10.000 personas e invadieron Ninghai, Fenghua, Tao Zhu y otros condados costeros de Zhejiang en un intento de capturar la capital de Taizhou. Qi Jiguang llevó al ejército de la familia Qi a adoptar estrategias y tácticas flexibles, utilizando ataques furtivos, emboscadas, ataques rápidos y otros métodos para confundir al enemigo. Más de 6.000 personas fueron aniquiladas en esta batalla y los invasores japoneses sufrieron un golpe devastador. Al año siguiente, los piratas japoneses invadieron Fujian a gran escala y las ciudades costeras fueron envenenadas por piratas japoneses. Qi Jiguang dirigió su ejército en Yuheng (ahora el mar en las afueras de la ciudad de Ningde, provincia de Fujian) para rescatar la guarida del enemigo y ganó la primera batalla. Posteriormente, lanzaron ofensivas continuas, aniquilando muchas fortalezas enemigas, matando a innumerables enemigos y repeliendo los ataques del enemigo. Al año siguiente, el enemigo reorganizó las tropas restantes y saqueó las ciudades fronterizas. Qi Jiguang ayudó una vez más a Fujian y, junto con el gobernador Tan Lun, los soldados generales Yu y los soldados generales de Guangdong, sofocaron a los enemigos a lo largo de las costas. de Fujian y Guangdong.
En el primer año de Jian'an (1567), Qi Jiguang fue trasladado al norte para proteger Jizhou por Zhang. En la ciudad de 16 se habla mucho de entrenamiento, manejo de armas y creación de planos de formación. Las tropas se reparan y administran estrictamente, y la apariencia militar es la mejor entre todas las partes. Debido al equipo estable y las excelentes tropas, los tártaros no se atrevieron a atacar fácilmente. Durante el período Wanli, las tribus mongoles acosaron las ciudades fronterizas tres veces y fueron derrotadas en todas ellas. Después de la muerte de Zhang, Qi Jiguang fue excluido y reasignado a Guangdong. En el decimotercer año de Wanli (1585), abdicó debido a una enfermedad y murió dos años después.