1. Regulación genética (interacción directa entre factores de transcripción y genes diana);
2. Mecanismo de interacción,
3. Regulación epigenética (cambios no secuenciales que afectan la estructura del ADN transcrito).
Control de la transcripción
La regulación directa de la expresión del ADN diana mediante factores de transcripción es la forma más sencilla y directa de cambiar el nivel de transcripción. Por lo general, hay varios sitios de unión a proteínas que rodean la región codificante de un gen, que tienen funciones específicas en la regulación de la transcripción. Los sitios comunes que regulan la unión de proteínas al ADN son potenciadores, aislantes y silenciadores. Existen muchos mecanismos para regular la transcripción. Pueden bloquear los sitios clave donde el ADN se une a la ARN polimerasa, o pueden servir como activadores para ayudar a la ARN polimerasa a unirse para promover la transcripción.
La actividad de los factores de transcripción está regulada aún más por señales intracelulares, lo que lleva a modificaciones postraduccionales de las proteínas, incluida la fosforilación/acetilación o la glicosilación. Estos cambios afectan directa o indirectamente la unión de los factores de transcripción al ADN promotor, el reclutamiento de la ARN polimerasa y el alargamiento de las moléculas de ARN recién sintetizadas.
La envoltura nuclear en eucariotas regula aún más la transcripción al permitir la persistencia de estos factores de transcripción en el núcleo. Los estímulos ambientales o las señales endocrinas pueden conducir a la modificación de las proteínas reguladoras, desencadenando cascadas de señalización intracelular. la regulación de la expresión genética.