¿Son suficientes 59 referencias para una tesis de maestría?

Suficiente.

El trabajo de fin de máster cuenta con unas 50 referencias.

De hecho, esto también es una cuestión de cara. Si escribes menos, el profesor pensará que has leído menos literatura y que el trabajo no es lo suficientemente profundo. En definitiva, se recomienda que haya no menos de 50 referencias.