La referencia cruzada consiste en utilizar el número de referencia para insertar texto como índice y debe ser una nota al final.
De modo que las referencias cruzadas y las notas finales no entran en conflicto y, por mucho que lo intentes, estás insertando el documento utilizando las funciones integradas de Word. En comparación con el uso de software de literatura, la ventaja de la función integrada de Word es que se puede saltar (algunos programas la admiten y otros no), pero la desventaja es que es más problemática. Al mismo tiempo, tienes que escribir la bibliografía tú mismo/buscar un lugar para generarla. Además, el índice generado de esta manera se basa en el orden bibliográfico, de hecho, debería ser al revés, es decir, el orden del índice determina el número bibliográfico.
Es más, si no utiliza un software de gestión de documentos y copia y pega la bibliografía directamente desde Internet, la calidad de la bibliografía definitivamente no será demasiado alta.