Los tiburones ballena se alimentan por filtración y se alimentan de zooplancton, macroalgas, krill y peces de tamaño pequeño y mediano. Sus dientes no son útiles para alimentarse, y de hecho su tamaño no es demasiado grande. En cambio, un tiburón ballena toma un sorbo de agua, cierra la boca y drena el agua a través de sus branquias. Durante el breve período entre el cierre de los labios y la apertura de las cubiertas branquiales, el zooplancton se enreda en escamas corticales de las branquias y la garganta. Este órgano humano, similar a un filtro, es una mutación genética específica de las branquiespinas, que puede bloquear todos los objetos de más de 2 a 3 mm, y el líquido será drenado.
Los tiburones ballena se reúnen en zonas rocosas frente a Belice y Curazao para alimentarse de los huevos del pargo gigante mexicano, que son liberados entre la luna llena y el cuarto creciente en mayo, junio y julio. Los ingredientes principales del tiburón ballena son el krill, los alevines de cangrejo, la piel de medusa, el atún, las anchoas, la caballa, el atún rojo pequeño y el calamar gigante. Los tiburones ballena generalmente se mueven de forma independiente y rara vez se reúnen a menos que busquen alimento en áreas ricas en alimentos. Los tiburones ballena machos son más activos que las hembras porque las hembras prefieren estar en lugares específicos.
Aunque los tiburones ballena son enormes, no es fácil que causen daños graves a las personas. Los biólogos los utilizan a menudo para la educación cultural y el desarrollo social. ¿No lo sabe Tiburón? ¿Canibalismo? . De hecho, los tiburones ballena tienen grandes personalidades y también jugarán con los buceadores de profundidad. Hay informes no confirmados de que los tiburones ballena permanecerán quietos y rotarán sus cuerpos para permitir a los buzos profundos eliminar los parásitos de sus cavidades abdominales. Los buceadores de profundidad pueden nadar con este pez gigante sin todos los riesgos, excepto el de ser golpeado accidentalmente por la enorme aleta caudal de un tiburón ballena durante una sesión.