Fujian tiene una larga historia y las actividades humanas existieron en una sociedad primitiva. Perteneciente a una rama de la etnia Guyue, se denomina "Dongyue". Durante el Período de los Reinos Combatientes, el Estado de Yue fue derrotado por los soldados del Estado de Chu. Algunos miembros de la familia real Yue huyeron al sur, a Fujian y al sur de Zhejiang, y sus descendientes se fusionaron con el pueblo de Fujian y se convirtieron en el "pueblo Minyue". Después de que Qin Shihuang unificó China en 221 a. C., Fujian estableció el condado de Minzhong, que apareció en el mapa chino por primera vez como una división administrativa. A mediados de la dinastía Tang, había cinco estados: Fu, Jian, Quan, Zhang y Ting. En el año 21 de Kaiyuan de la dinastía Tang (733 d. C.), se fortaleció la defensa fronteriza y se estableció el "Cuerpo Económico de Fujian". Así surgió la palabra "Fujian". Durante las Cinco Dinastías, el rey de Fujian estableció el Estado de Fujian con base en Fujian, que básicamente estableció las fronteras provinciales posteriores. Fujian también se conoce como "Ocho Fujian". En la dinastía Song del Sur, Fujian construyó el gobierno L, cinco estados, dos ejércitos y ocho agencias administrativas al mismo nivel, por lo que se llamó "Ocho Fujian". Después de la dinastía Song, el antiguo sistema básicamente continuó. Taiwán se añadió en el año 23 del emperador Kangxi de la dinastía Qing (1684 d. C.), y se estableció otra provincia en el año duodécimo del emperador Guangxu (1886 d. C.). Al final de la dinastía Qing, Fujian tenía 9 prefecturas, 2 estados, 58 condados y 6 departamentos. Después de la Revolución de 1911, en el segundo año de la República de China (1913 d.C.), se abolió el sistema prefectura-prefectura y se estableció un sistema de tres niveles de provincias, prefecturas y condados. Después de varios ajustes, antes de la liberación, la provincia tenía 2 ciudades, 7 distritos de inspección administrativa y un total de 67 condados. Después de la liberación de Fujian en 1949, la provincia tenía 2 ciudades, 8 distritos y 67 condados. En 1951, se agregaron Quanzhou y Zhangzhou y se confió el liderazgo de la agencia. En los 20 años siguientes, las divisiones administrativas se adaptaron varias veces. Desde la reforma y apertura, Fujian ha ajustado sus divisiones administrativas de acuerdo con sus propias características, y las regiones se han transformado en ciudades a nivel de prefectura, formando un sistema de ciudad-condado. A finales de 2000, la provincia tenía 9 ciudades a nivel provincial, incluidas 14 ciudades a nivel de condado, 25 distritos municipales y 46 condados (incluido el condado de Kinmen).
Fujian tiene una larga historia, y la ciencia y la cultura alguna vez fueron prósperas. Hace 5.000 años, nuestros antepasados prosperaron aquí y crearon la cultura Tanshishan, que es comparable a las culturas Yangshao y Hemudu. Durante el período de los Tres Reinos, debido al desarrollo de la tecnología de navegación y construcción naval, Fujian se convirtió en la base naval y el puerto de comercio exterior de Sun Wu. Desde la dinastía Song del Sur hasta la dinastía Yuan, Quanzhou se convirtió en uno de los puertos comerciales más grandes del mundo, teniendo relaciones comerciales con más de 65.438.000 países y regiones, formando la famosa "Ruta Marítima de la Seda". Durante la dinastía Ming, Zheng He hizo siete viajes a Occidente, deteniéndose muchas veces en Fujian para reclutar marineros, construir barcos y zarpar desde Fujian. En el quinto año del reinado de Tongzhi en la dinastía Qing, la Oficina de Envíos de Fuzhou y la primera academia naval de China se establecieron en Mawei. Se convirtió en la cuna de la marina y la industria de construcción naval modernas de China. Fujian tiene una larga historia de personas talentosas, entre ellas el astrónomo Su Song, Song Ci, el creador de la medicina forense mundial, el pensador y escritor Li Zhi, el fonólogo Chang Di, los eruditos y calígrafos Huang Daozhou y Cai Xiang, los literatos Yan Yu, Yang Yi, Liu Yong, los historiadores Zheng Qiao y Yuan Shu, los héroes nacionales Zheng Chenggong y Lin Zexu, los pensadores y traductores Yan Fu y Lin Zexu. Con su valentía y dedicación, han hecho contribuciones indelebles al desarrollo y la prosperidad de la nación china.
Históricamente, el pueblo de Fujian ha librado innumerables luchas heroicas contra la opresión y la agresión, y tiene una gloriosa tradición revolucionaria. Bajo el liderazgo del Partido Comunista de China, el pueblo de Fujian ha dedicado miles de hijos e hijas destacados y ha hecho contribuciones destacadas a la causa de la liberación del pueblo chino. Fujian es una de las provincias clave con áreas antiguas del país, con áreas antiguas distribuidas en 62 condados (ciudades). Hay 46 antiguos condados (ciudades), 518 antiguos municipios (pueblos), 7.772 antiguas aldeas administrativas y 2.919 antiguas aldeas revolucionarias.