La Universidad Shihezi es una de las universidades clave del “Proyecto 211” Nacional, la Universidad Nacional Clave de Desarrollo Occidental, y una de las universidades construidas conjuntamente por la provincia y el gobierno. También es una de las universidades seleccionadas para el "Proyecto de Fortalecimiento de Capacidades Básicas de las Universidades Centrales y Occidentales" y el "Proyecto de Mejoramiento Integral de la Fortaleza de las Universidades Centrales y Occidentales" (una escuela por provincia).
La predecesora de la escuela nació en la Gran Marcha del Ejército Popular de Liberación de China para liberar Xinjiang en septiembre de 1949. En abril de 1996, se fusionaron y establecieron la Facultad de Agricultura de Shihezi, la Facultad de Medicina de Shihezi, la Facultad Normal del Cuerpo y la Facultad de Economía del Cuerpo.