El Departamento Provincial de Transporte cuenta con 10 departamentos funcionales (oficinas): Oficina, Departamento de Políticas y Regulaciones, Departamento de Planificación, Departamento de Construcción, Departamento de Finanzas (Oficina de Gestión de Cobro de Recargos por Compra de Vehículos), Departamento de Educación en Ciencia y Tecnología, Departamento de Gestión del Transporte El Departamento de Supervisión de Seguridad, el Departamento de Administración de Carreteras, el Departamento de Auditoría, el Departamento de Recursos Humanos, así como el Comité del Partido de la agencia, el Equipo de Inspección Disciplinaria (Oficina de Supervisión) y el Transporte por Carretera, Sindicato de Marineros y Carreteras. Las Oficinas de Control del Caos tienen 73 nombres de establecimientos administrativos. Los nueve distritos y ciudades de la provincia tienen una comisión de transporte (Xiamen) y ocho oficinas de transporte, y cada condado (ciudad, distrito) tiene una oficina de transporte.
Hay 15 empresas e instituciones directamente bajo el departamento: Provincial Expressway Co., Ltd., Escuela Técnica y Vocacional de Transporte de Fujian, Administración Provincial de Carreteras (Oficina Provincial de Recaudación de Carreteras, Oficina Provincial de Administración de Carreteras), Provincia Oficina de Administración de Puertos y Navegación (Oficina Provincial de Administración de Vías Navegables, Oficina Provincial de Seguridad Marítima Local, Oficina Provincial de Inspección de Buques), Oficina Provincial de Administración de Transporte, Instituto Provincial de Investigación de Ciencia y Tecnología del Transporte (Centro Provincial de Información de Ciencia y Tecnología Económica del Transporte, Medición de equipos de prueba de automóviles de Fujian) y Estación de Calibración), Instituto Provincial de Diseño de Planificación del Transporte, Estación Provincial de Inspección y Supervisión de Calidad de Proyectos de Infraestructura de Transporte (Estación Provincial de Supervisión de Proyectos de Construcción de Transporte), Estación Provincial de Gestión de Costos de Ingeniería de Transporte, Empresa Consultora de Supervisión de Proyectos de Construcción de Transporte Provincial, Oficina Provincial de Planificación del Transporte, Provincia Centro de Información y Comunicaciones sobre Transporte, la estación de reporteros del Periódico de Transporte de China en Fujian, el Centro de Servicios de Intercambio de Talentos del Departamento Provincial de Comunicaciones y el Centro Provincial de Capacitación del Personal de Comunicaciones. Entre ellos, la Sede Provincial de Construcción de Autopistas y Provincial Expressway Co., Ltd. comparten ubicación. El sistema de transporte de la provincia tiene 127.000 empleados, incluidos 30.200 empleados en unidades afiliadas al departamento, 4.519 miembros del partido directamente dependientes del departamento y 22 comités del partido, 16 ramas generales del partido y 193 ramas del partido.