Southwestern University se formó en 2005 mediante la fusión de Southwest Normal University, anteriormente directamente dependiente del Ministerio de Educación, y Southwest Agriculture University, anteriormente directamente dependiente del Ministerio de Agricultura. Las dos escuelas se construyeron originalmente una al lado de la otra y tienen el mismo origen, que se remonta a la Escuela Normal del Este de Sichuan establecida en 1906.
En 1936, pasó a llamarse Escuela de Educación de Sichuan. En 1950, el Instituto Provincial de Educación de Sichuan se fusionó con el Colegio Normal Nacional de Mujeres fundado en 1940 y el colegio secundario privado Xianghui fundado en 1946 para formar la Universidad Normal del Suroeste y el Colegio Agrícola del Suroeste, respectivamente. De 65438 a 0985, las dos escuelas pasaron a llamarse Universidad Normal del Suroeste y Universidad Agrícola del Suroeste, respectivamente.
El sitio web oficial de la escuela en marzo de 2016 mostró que Southwest University tiene 1 laboratorio nacional clave, 1 centro nacional de investigación de tecnología de ingeniería, 1 base de cultivo de laboratorio nacional clave construida por departamentos provinciales, 10 laboratorios clave de educación del Ministerio de Educación o el Ministerio de Agricultura, y 3 centros de investigación en ingeniería del Ministerio de Educación.
El "Plan 111" incluye 3 bases de innovación e introducción de talento, 2 estaciones nacionales de observación científica y experimentales de campo, 2 estaciones científicas de observación y experimentales del Ministerio de Agricultura, 2 bases de campo del Ministerio de Tierras y Recursos y 1 Parque Científico y Tecnológico de la Universidad Nacional, 1 Base de Investigación Clave de Humanidades y Ciencias Sociales del Ministerio de Educación y 13 Base de Investigación Clave de Humanidades y Ciencias Sociales de Chongqing.