La investigación internacional sobre proteómica avanza rápidamente y tanto las teorías básicas como los métodos técnicos se mejoran y perfeccionan constantemente. Se han creado bases de datos de proteomas para bastantes tipos de células y han aparecido uno tras otro los correspondientes sitios web en Internet. Desde 65438 hasta 0996, Australia estableció el primer centro de investigación de proteomas del mundo: el Centro Australiano de Análisis de Proteomas (APAF). Dinamarca, Canadá y Japón también han establecido centros de investigación de proteomas. En los Estados Unidos, con el apoyo de enormes recursos financieros, las principales empresas y compañías farmacéuticas también se han unido a la línea de investigación en proteómica. GeneProt, una empresa fundada en Suiza el año pasado, fue fundada por investigadores de proteomas, más conocidos por su base de datos de proteomas "SWISSPROT". Para desarrollar nuevos objetivos farmacológicos utilizando tecnología proteómica, se ha establecido una plataforma de tecnología cuantitativa de paso alto equipada con cientos de espectrómetros de masas. Normsn G. Anderson, el científico estadounidense que propuso el Índice de Proteína Humana, también creó una empresa de proteómica similar para continuar con su sueño que no se ha realizado durante muchos años. En abril de 2001, se estableció la Organización Internacional de Investigación del Proteoma Humano (HUPO) en los Estados Unidos, y posteriormente se establecieron organizaciones regionales de investigación del proteoma en Europa y la región de Asia y el Pacífico, tratando de completar el proyecto del proteoma humano mediante la cooperación y la integración de varios efectivo.
Aunque la proteómica no se publica desde hace mucho tiempo, se ha explorado vigorosamente en el estudio de la proliferación, diferenciación, transformación anormal y formación de tumores celulares, involucrando leucemia, cáncer de mama, cáncer de colon, cáncer de vejiga, y cáncer de próstata, cáncer de pulmón, cáncer renal y neuroblastoma, e identificó una serie de proteínas relacionadas con tumores, lo que proporciona una base importante para el diagnóstico temprano de tumores, el descubrimiento de objetivos farmacológicos, el juicio de eficacia y el pronóstico.
En vista de las perspectivas de desarrollo de la proteómica y la importancia de la tecnología avanzada, los principales países desarrollados occidentales han invertido mucho en la investigación de la proteómica. Por ejemplo, los Institutos Nacionales de Salud, el Departamento de Energía de Estados Unidos, la Comunidad Europea, etc. Se han iniciado investigaciones sobre diferentes proteomas biológicos y se han logrado avances significativos, con una serie de artículos de investigación de alta calidad publicados en revistas académicas de renombre internacional. Dado que la investigación proteómica es más práctica que la investigación genómica y tiene enormes perspectivas de mercado, las empresas y las compañías farmacéuticas también han invertido mucho dinero en la investigación proteómica. Celera, que completó de forma independiente la secuenciación del genoma humano, anunció que invertirá cientos de millones de dólares en este campo. Protein Group Inc. y Block Mass Spectrometer Manufacturing Company han unido fuerzas para crear el centro de investigación de Protein Group más grande del mundo. Para promover el desarrollo, la cooperación y el intercambio de proteomas nacionales y regionales, se estableció el Grupo Internacional del Proteoma Humano (HUPO), se celebró el primer Congreso Internacional del Proteoma en Francia y se establecieron sucursales correspondientes en América del Norte, Europa y Corea del Sur. y Japón. La proteómica se ha convertido en un "punto caliente" en los principales países desarrollados occidentales y en los grupos farmacéuticos multinacionales.