Los métodos de investigación de la proteómica incluyen la identificación de proteínas, la modificación postraduccional, la determinación de la función de las proteínas y la tecnología de cuantificación dirigida a proteínas.
1. Identificación de proteínas: la electroforesis unidimensional y la electroforesis bidimensional combinadas con tecnologías occidentales y otras se pueden utilizar para identificar proteínas mediante técnicas como chips de proteínas, chips de anticuerpos e inmunoprecipitación.
2. Modificación postraduccional: Muchas proteínas producidas por expresión de ARNm sufren modificaciones postraduccionales como fosforilación, glicosilación, activación de zimógeno, etc. La modificación postraduccional es una forma importante para que las proteínas regulen sus funciones, por lo que el estudio de las modificaciones postraduccionales de las proteínas juega un papel importante en el dilucidar la función de las proteínas.
3. Determinación de la función proteica: como análisis de la actividad enzimática y determinación de sustratos enzimáticos, análisis biológico de citoquinas/análisis de unión ligando-receptor. Se pueden utilizar tecnologías de desactivación genética y antisentido para analizar la función de los productos de expresión genética: proteínas. Además, estudiar la localización de las proteínas en las células después de su expresión también ayuda a comprender hasta cierto punto la función de las proteínas. El sistema de expresión de proteínas fluorescentes de Clontech es una excelente herramienta para estudiar la localización de proteínas dentro de las células.
4. Para los humanos, la investigación proteómica debe, en última instancia, servir a la salud humana, principalmente promoviendo el desarrollo de la medicina molecular. Como encontrar moléculas objetivo de fármacos. Muchos fármacos son proteínas en sí mismos y las moléculas diana de muchos fármacos también son proteínas. Las drogas también pueden interferir con las interacciones proteína-proteína.