Esta orden es uno de los grupos importantes en entomología médica y veterinaria. La importancia médica se refleja en dos aspectos: primero, la invasión directa. Después de que las pulgas parasitan a humanos, animales y aves de corral y chupan sangre, su saliva puede causar dermatitis, picazón o reacciones alérgicas, afectando la vida e incluso la seguridad de la vida. Por ejemplo, la pulga transdérmica hembra en África tropical y América Central y del Sur se esconde principalmente en la superficie del suelo para vivir debajo de la piel de los dedos de los pies de humanos y animales, y causa infección secundaria e incluso la muerte a través de heridas en la piel. Los ctenóforos que parasitan a gatos y perros en grandes cantidades durante mucho tiempo, las pulgas vermiformes y las pulgas de pico largo que parasitan a las ovejas y al ganado vacuno, y las pulgas de las aves de corral que parasitan a los pollos, son plagas mundialmente famosas. Más importante aún, las pulgas pueden transmitir directamente enfermedades transmitidas por pulgas, especialmente la peste bubónica. En la Edad Media en Europa, la peste mató a una cuarta parte de la población. Todavía existen focos naturales de plaga animal en muchas partes del mundo. Hay casi 200 especies y subespecies de pulgas infectadas naturalmente con Yersinia pestis en todo el mundo, y en China aún se deben tomar medidas de vigilancia en estas áreas epidémicas. Además, las pulgas, especialmente Indochina spp., son los principales vectores del tifus murino. Entre roedores y mamíferos, las pulgas mantienen y transmiten la tularenosis y la encefalitis rusa. La pulga del conejo europeo transmite el virus del tumor pegajoso del conejo, que ha causado desastres en las granjas de conejos del Reino Unido.
Debido a la plaga rampante de conejos europeos introducidos en Oceanía, se han utilizado deliberadamente pulgas de conejo europeo para eliminar biológicamente a los conejos. Se descubrió hace mucho tiempo que las pulgas son los huéspedes de las tenias caninas. Las pulgas se transmiten entre perros y gatos y, en ocasiones, entre niños, provocando la enfermedad por tenias.