Después de 1960, Ramos ocupó cargos importantes en el ejército filipino: Presidente de la Comisión de Guerra No Convencional de las Fuerzas Armadas, Comandante de las Fuerzas Aerotransportadas Especiales del Ejército, Asistente del Presidente para Asuntos Militares, Asistente del Jefe del General Estado Mayor y Director del Negociado de Inteligencia, Comandante del Centro de Entrenamiento de Defensa Civil de las Fuerzas Armadas, Comandante de las Fuerzas de Seguridad y Director del Cuerpo Nacional de Policía, Subjefe de Estado Mayor General, Jefe de Estado Mayor en funciones, etc. , y ha estado involucrado en trabajos de inteligencia militar durante mucho tiempo.
Después de las elecciones filipinas de febrero de 1986, Marcos y Corazón Aquino declararon la victoria en las elecciones y prestaron juramento como presidentes respectivamente. En este momento crítico, Ramos, entonces subjefe de Estado Mayor de las Fuerzas Armadas de Filipinas, y el exsecretario de Defensa Enrile anunciaron su separación del gobierno de Marcos y apoyaron a Corazón Aquino, lo que llevó al colapso del gobierno de Marcos. Fue nombrado jefe de estado mayor y se le concedió el rango de general. Desde entonces, Ramos ha ayudado a Aquino a sofocar siete golpes de estado. En 1988, el presidente Aquino le otorgó la Medalla de Honor, el más alto honor. Ese mismo año, Ramos dimitió como ministro de Defensa. Ganó las elecciones presidenciales en 1992 1 y asumió la presidencia de Filipinas en junio del mismo año. Dejó el cargo en junio de 1998. Su sucesor fue José Estrada.
Desde entonces, ha participado activamente en las actividades de organismos internacionales. Se ha desempeñado sucesivamente como Presidente del Foro de Boao para Asia, Presidente de la Fundación Ramos para la Paz y el Desarrollo, Director Honorario de la Fundación MacArthur, Fundador del Comité Asesor de Políticas y de la Organización Mundial de la Propiedad Intelectual, Director del International Crisis Group, Director Honorario Miembro del Comité de Recursos Hídricos del Siglo XXI y Presidente Honorario Vitalicio.